O PPG-BIONORTE é formado por colegiados e comissões assim identificados:
- 
Colegiado Geral do Programa de Pós-Graduação (COLG-PG);
- 
Comissão de Coordenação Geral do Programa de Pós-Graduação (CoG-PG).
- 
Colegiados Estaduais do Programa de Pós-Graduação (COLE-PGs);
- 
Comissões de Coordenações Estaduais do Programa de Pós-Graduação (CoE-PGs)
O modelo de gestão do PPG-BIONORTE pode ser representado pelo seguinte diagrama:
 
Composição do Colegiado Geral (COLG)
- Coordenador Geral
- Vice-coordenador Geral
- Secretário Executivo
- Coordenadores Estaduais
- Presidente do Conselho Científico da Rede BIONORTE
- Um Representante Discente
Comissão do Colegiado Geral (CoG)
- Coordenador Geral
- Vice-coordenador Geral
- Dois representantes do corpo docente
- Representante do corpo discente
Composição dos Colegiados Estaduais (COLE)
- Todos os docentes credenciados no Programa e pertencente àquele Estado
- Um representante do Comitê Científico Estadual da Rede BIONORTE
- Um representante do Corpo Discente do Estado
Comissões dos Colegiado Estaduais (CoE)
- Coordenador Estadual
- Vice-coordenador Estadual
- Dois docentes do Estado credenciados no Programa
- Um representante discente