Bionorte em Números
Leonardo de Azevedo Calderon
| Citações | CALDERON, L.A.;CALDERON, L. DeA;CALDERON, L. D.;CALDERON, Leonardo de Azevedo;Azevedo Calderon, Leonardo de;Calderon, Leonardo de A.;Calderon, Leonardo A.;A. Calderon, Leonardo;Calderon, Leonardo;A., Leonardo;DE A. CALDERON, L.;CALDERÓN, LEONARDO DE A.;CALDERON, LEONARDO A;CALDERÓN, LEONARDO A.;DE AZEVEDO CALDERON, LEONARDO |
| Titulação | Pós-Doutorado |
| Área | CIENCIAS_BIOLOGICAS :: Bioquímica |
Formação
- Pós-Doutorado - Periodo: 2008 a 2009 - Instituto de Pesquisas em Patologias Tropicais de Rondônia
- Doutorado - Periodo: 2000 a 2004 - Ciências Biológicas (Biologia Molecular)
Universidade de Brasília - Graduação - Periodo: 1995 a 2000 - Ciências Biológicas
Universidade de Brasília
Atuação Profissional
- Acta Amazonica (Impresso)- / Periodo: 2015 a atual
- Associação Educacional e Assistencial Dr Aparicio Carvalho De Moraes- / Periodo: 2019 a 2019
- Biochimie (Paris. Print)- / Periodo: 2014 a atual
- BioMed Research International- / Periodo: 2013 a atual
- British Biotechnology Journal- / Periodo: 2015 a atual
- British Journal of Pharmaceutical Research- / Periodo: 2012 a atual
- Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior- / Periodo: 2012 a atual
- DNA-Tec Projetos Tecnológicos- / Periodo: 2005 a 2006
- Faculdade da Terra de Brasília- / Periodo: 2001 a 2003
- Faculdade JK- / Periodo: 2001 a 2006
- Fundação de Tecnologia do Estado do Acre- / Periodo: 2009 a atual
- Fundação Oswaldo Cruz- / Periodo: 2014 a atual
- Fundação Oswaldo Cruz- / Periodo: 2011 a 2014
- Instituto de Pesquisas em Patologias Tropicais de Rondônia- / Periodo: 2008 a 2011
- Instituto Federal de Educação Ciência e Tecnologia de Rondônia- / Periodo: 2020 a atual
- INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES- / Periodo: 2017 a atual
- Journal of Medicinal Plants Research- / Periodo: 2012 a atual
- Journal of Toxins- / Periodo: 2013 a atual
- Langmuir- / Periodo: 2014 a atual
- Ministério da Ciência, Tecnologia e Inovação- / Periodo: 2011 a 2014
- Pharmaceutical Biology- / Periodo: 2014 a atual
- RADIO TV AMAZONAS LTDA- / Periodo: 2020 a atual
- Recent Patents on Endocrine, Metabolic & Immune Drug Discovery- / Periodo: 2012 a atual
- Rede de Biodiversidade e Biotecnologia da Amazônia Legal- / Periodo: 2012 a 2018
- Rede de Biodiversidade e Biotecnologia da Amazônia Legal- / Periodo: 2011 a 2012
- Revista Brasileira de Farmacognosia- / Periodo: 2009 a atual
- Revista Fiocruz Rondônia- / Periodo: 2013 a atual
- The Journal of Venomous Animals and Toxins Including Tropical Diseases (CD-- / Periodo: 2014 a atual
- Universidade de Brasília- / Periodo: 1995 a 2005
- Universidade de Brasília- / Periodo: 1999 a 2000
- Universidade Federal de Rondônia- / Periodo: 2017 a atual
- Universidade Federal de Rondônia- / Periodo: 2014 a 2014
- Universidade Federal de Rondônia- / Periodo: 2012 a 2014
- Universidade Federal de Rondônia- / Periodo: 2010 a 2012
- Universidade Federal de Rondônia- / Periodo: 2009 a 2010
- Universidade Federal de Rondônia- / Periodo: 2008 a 2009
- Universidade Federal do Acre- / Periodo: 2006 a 2009
- Universidade Federal do Amazonas- / Periodo: 2011 a 2018
Linha de Pesquisa
- Bioprospecção e bioensaios
- Desenvolvimento de Novos Fármacos
- Prospecção de bioativos da Amazônia úteis a saúde humana
- Toxinologia
Projetos de Pesquisa
- [COORDENADOR] UNIVERSAL FAPERO - Desenvolvimento racional de drogas para terapia da malária baseadas em minipeptídeos miméticos projetados por computação
Período: 2024 - atual / Situação: EM_ANDAMENTO / Natureza: DESENVOLVIMENTO - [COORDENADOR] SINAPSEBIO - Smart Active Ingredients Lab
Período: 2023 - atual / Situação: EM_ANDAMENTO / Natureza: DESENVOLVIMENTO - Identificação de interações entre PLA2 com catepsinas do microambiente tumoral (TME) e avaliação de sua atividade em valores de pH identificados em TMEs: identificação de substratos
Período: 2022 - atual / Situação: EM_ANDAMENTO / Natureza: PESQUISA - COORDENADOR] INOVA FIOCRUZ - Implementação de um protocolo automatizado de virtual high throughput screening super massivo para desenvolvimento de novos fármacos
Período: 2022 - 2024 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: DESENVOLVIMENTO - [COORDENADOR] INOVA FIOCRUZ - Aplicabilidade in vitro, in silico e in vivo do composto Cloridrato de metoxiverapamil contra Leishmania (L.) amazonensis.
Período: 2021 - 2023 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: DESENVOLVIMENTO - [COORDENADOR] INOVA FIOCRUZ - Implementação de uma estratégia de triagem virtual de alto desempenho (vHTS) guiada por aprendizado de máquina (ML) para o desenvolvimento de drogas peptídicas sintéticas contra alvos validados do Sars-Cov-2.
Período: 2021 - 2023 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: DESENVOLVIMENTO - [COORDENADOR] PRÓ RONDÔNIA FAPERO/CAPES 012/2016 VAGAS REMANESCENTES. Desenvolvimento racional de peptídeos bioativos inspirados em toxinas de anuros e serpentes uteis para a terapia de malária e leishmaniose
Menor do que as proteínas, peptídeos desempenham papéis diversificados em muitos processos fisiológicos, onde a maioria das reações químicas, respostas biológicas e os processos regulatórios são modulados em alguma parte por sequências de aminoácidos específicas. Estas sequências funcionais e as suas atividades biológicas, utilizadas de modo a conceber peptídeos sintéticos curtos, que apresentam alta especificidade, estabilidade e facilidade de sintetize criou recentemente um novo campo diversificado de moléculas altamente aplicáveis na indústria farmacêutica, biotecnológica e de cosméticos resultando em patentes e produtos baseados em peptídeos terapêuticos. Os peptídeos podem ser facilmente e amplamente modificados através de substituição de aminoácidos e a utilização de mais de 250 resíduos não genéticos, além de várias modificações nas regiões N e C terminais, para utilização em terapias miméticas. Uma das fontes mais interessantes para busca de peptídeos e proteínas bioativas para mimetização está na biodiversidade da herpetofauna, pois todos os anuros e serpentes squamata produzem secreções glandulares venenosas compostas por uma mistura complexa de bioativos utilizados contra presas e potenciais predadores com funções homólogas a hormônios, neurotransmissores, antimicrobianos, antiparasitários e inibidores enzimáticos, além de outras com atividade ainda desconhecida. Recentemente, estes venenos têm sido reconhecidos como uma fonte proteínas e peptídeos eficazes contra protozoários do gênero Leishmania e Plasmodium, sendo potencialmente viáveis para o desenvolvimento de peptídeos miméticos que podem ser utilizados como protótipos de novas drogas. Neste sentido, o uso destas moléculas pode proporcionar novas e mais eficientes terapias contra Leishmanioses e Malária em face à emergência de casos de resistência. Estudos desenvolvidos pelo Centro de Estudos de Biomoléculas Aplicadas a Saúde (CEBio) da Fiocruz em Rondônia já identificaram venenos de anuros e serpentes, frações e toxinas com potente atividade Leishmanicida e Plasmodicida. Neste projeto, propomos o uso destas toxinas para o desenvolvimento de peptídeos sintéticos visando à promoção de potencial aplicação terapêutica, no intuito de propor novas moléculas úteis para o desenvolvimento de protótipos para a terapia de leishmaniose e malária.
Período: 2016 - 2022 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: DESENVOLVIMENTO - [COORDENADOR] UNIVERSAL FAPERO 003/2015. Desenvolvimento racional de peptídeos leishmanicidas inspirados em toxinas da herpetofauna
A biodiversidade molecular presente nos venenos de serpentes é uma das fontes mais interessantes para busca de peptídeos bioativos para mimetização, devido ao fato de que todas as serpentes do gênero Bothrops produzem secreções glandulares venenosas, compostas por uma mistura complexa de moléculas utilizadas contra presas e potenciais predadores desempenhando funções homólogas a hormônios, neurotransmissores, antimicrobianos, antiparasitários e inibidores enzimáticos, além de outras atividades biológicas desconhecidas. Os peptídeos desempenham papéis diversificados em muitos processos fisiológicos, onde a maioria das reações químicas, respostas biológicas e os processos regulatórios são modulados em alguma parte por sequências de aminoácidos específicas. E dentre eles encontra-se a classe dos peptídeos antimicrobianos (AMPs), que estão cada vez mais em evidência, pelo fato de serem reconhecidos como potenciais agentes contra bactérias, fungos, parasitas, vírus e câncer. Estas sequências funcionais e as suas atividades biológicas, podem ser utilizadas de modo a desenvolver mimeticamente e projetar peptídeos sintéticos com alta especificidade, estabilidade e facilidade de síntese, por meio de modificações nas regiões amino e carboxi terminal, na quiralidade, na cadeia lateral e de grupos quimicos, além de ciclização e alquilação do nitrogênio amida. Com isso, a síntese química de peptídeos propõe estrátegias de modificações e design químico para a produção de péptidos miméticos com menor susceptibilidade à proteólise e melhor biodisponibilidade, aumentado a probabilidade de transformar um determinado peptídeo em potencial fármaco. Neste projeto, propomos a desenvolvimento e aplicabilidade da técnica de síntese química em fase sólida de peptídeos naturais e análagos com atividade antimicrobiana e anti-Leishmania inspirados em bioativos presentes nos venenos das serpentes Bothrops atrox e Bothrops jararacussu, visando à promoção de potencial aplicação terapêutica, no intuito de propor novos peptídeos miméticos úteis para o desenvolvimento de protótipos terapêuticos.
Período: 2016 - 2021 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: DESENVOLVIMENTO - [COORDENADOR] PQR FAPERO 003/2017. Desenvolvimento racional de peptídeos bioativos inspirados em toxinas de anuros e serpentes úteis para a saúde humana
Período: 2017 - 2021 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: DESENVOLVIMENTO - [COORDENADOR] CNPq 311616/2017-8. Desenvolvimento racional de drogas baseadas em peptídeos: Inovação inspirada na atividade leishmanicida e plasmodicida de peptídeos e proteínas de anuros e serpentes
Menor do que as proteínas, peptídeos desempenham papéis diversificados em muitos processos fisiológicos, onde a maioria das reações químicas, respostas biológicas e os processos regulatórios são modulados em alguma parte por sequências de aminoácidos específicas. Estas sequências funcionais e as suas atividades biológicas, utilizadas de modo a conceber peptídeos sintéticos artificiais curtos, que apresentam alta especificidade, estabilidade e facilidade de sintetize criou recentemente um novo campo diversificado de moléculas altamente aplicáveis na indústria farmacêutica, biotecnológica e de cosméticos resultando em patentes e produtos baseados em peptídeos terapêuticos. Peptídeos podem ser amplamente modificados através de substituição de aminoácidos, utilização de centenas de resíduos não genéticos, além de várias modificações nas regiões N e C terminais, a fim de potencializar sua seletividade, estabilidade e biodistribuição. Venenos de serpentes são fontes relevantes para busca de proteínas e peptídeos bioativos úteis para uso em processos de mimetização molecular e desenvolvimento de novas entidades químicas. Recentemente, estes venenos têm sido reconhecidos como uma fonte proteínas e peptídeos eficazes contra protozoários do gênero Leishmania e Plasmodium, sendo potencialmente viáveis para o desenvolvimento de peptídeos miméticos que podem ser utilizados como protótipos de novas drogas. Neste intento, o uso destas moléculas proporcionam novas e potencialmente mais eficientes terapias contra Leishmanioses e Malária em face à emergência de novos casos de resistência e ao baixo número de alternativas terapêuticas. Visto que a seguinte proposta visa buscar, por meio da realização de pesquisa e inovação, o desenvolvimento de produtos biotecnológicos com potencial de serem transferidos ao setor produtivo em saúde, contribuindo para a melhoria da qualidade da terapia de malária e leishmanioses, que afetam os segmentos mais vulneráveis da população brasileira, além de reduzir a dependência tecnológica do país dos grandes grupos farmacêuticos, esta proposta esta claramente enquadrada na área de biotecnologia
Período: 2018 - 2020 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA - [COORDE] Avaliação da atividade in vitro e in vivo de Cloridrato de metoxiverapamil contra Leishmania (L.) amazonensis, interação in silico e atividade in vitro contra o alvo molecular Tripanotiona redutase e determinação do seu possível mecanismo de ação
Programa Inova Fiocruz - Edital Pós-Doutorado Júnior. https://portal.fiocruz.br/sites/portal.fiocruz.br/files/documentos/divulgacao_de_resultado_-_pos-doutorado_junior_final_-_08.08.pdf
Período: 2019 - 2020 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: DESENVOLVIMENTO - [COORDENADOR] Chamada Publica MCTI/FINEP/FNDCT 02/2016 - Centros Nacionais Multiusuário. Implementação da REDE DE PLATAFORMAS TECNOLÓGICAS MULTI USUÁRIO (REDETEC) da Universidade Federal de Rondônia: Aquisição das Centrais de Imagem, Genética e Espectrosc
Período: 2018 - 2019 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA - [COORDENADOR] Prospecção e caracterização de bioativos uteis a saúde humana a partir da biodiversidade da Amazônia Legal
O presente projeto tem o objetivo identificar, isolar e produzir, em nível experimental, protótipos de novas drogas derivadas de moléculas de origem vegetal, animal e microbiana oriundas da biodiversidade brasileira, ou especificamente sintetizadas, ativas contra alvos moleculares de vias metabólicas particulares de parasitas da malária humana e de seus respectivo vetor inseto, o Anopheles darlingi. O material de partida para o screening serão extratos de plantas, secreções e venenos de animais, metabólitos secretados por microrganismos endofíticos e actinomicetos oriundos em sua maioria da biodiversidade amazônica, e também compostos produzidos ou modificados por síntese química. A atividade anti-parasitária e/ou anti-vetorial dos produtos desenvolvidos, sejam estes obtidos por purificação clássica, detectados e isolados por ressonância plasmônica de superfície (SPR), ou sintetizados, serão analisados in vitro na forma livre ou nanoencapsulados utilizando-se modelos de culturas celulares, e em infecções experimentais in vivo, quando testados contra os parasitas, ou contra os vetores respectivos em suas diferentes fases de desenvolvimento. Paralelamente serão realizados experimentos de screenig virtual, utilizando ferramentas de docking e dinâmica molecular para identificação de substâncias capazes de interagir com o centro ativo de enzimas identificadas com alvos validados, onde serão utilizadas estruturas moleculares conhecidas depositadas em bancos de dados disponíveis, que serão adquiridas por fornecedores comerciais para realização de testes quanto suas reais capacidades de inibição das enzimas e potencial diminuição/eliminação da parasitemia em ensaios in vitro e in vivo. Os protótipos serão desenvolvidos a partir das moléculas líderes indentificadas que servirão de base para a síntese de compostos químicos variantes que também serão testados quanto suas atividades anti-parasitárias. Em resumo, o objetivo da presente proposta é gerar protótipos anti-maláricos e inseticidas devidamente estudados em fase pré-clínica e registrados em patentes que possam ser encaminhados a ensaios de caracterização toxicológica e futuros testes clínicos, gerando consequentemente conhecimento e difusão tecnológica com viabilidade econômica para o país
Período: 2014 - 2019 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA - [COORDENADOR] CAFIX FAPERO 006/2017. Desenvolvimento racional de peptídeos bioativos inspirados na biodiversidade úteis para a saúde humana
Período: 2017 - 2019 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: DESENVOLVIMENTO - [COORDENADOR] FAPERO DOUTORADO 009/2016. Desenvolvimento racional de peptídeos inspirados na região c-terminal de toxinas de venenos de serpentes
Concessão de uma Bolsa de Doutoramento pelo período de 48 meses
Período: 2016 - 2019 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: DESENVOLVIMENTO - [COORDENADOR] L'ORÉAL. Rational design and development of bioactive peptides
Smaller than proteins, typically consisting of fewer than fifty amino acid residues, peptides play diversified roles in many physiological processes. According to Zhang & Falla (2009), ?in nature, the majority of chemical reactions, biological responses, and regulatory processes are modulated in some part by specific amino acid sequences?. The use of these functional sequences and their biological activities, in order to design short, stable, and readily synthesizable peptides has created a diverse new field of molecules highly applicable to the pharmaceutical, biotech and cosmetic industries
Período: 2015 - 2019 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: DESENVOLVIMENTO - [COORDENADOR] Chamada Pública MCTIC/FINEP/FNDCT 04/2016. Referência: 0662/16Aquisição de tecnologias multiusuários para ampliação da capacidade tecnico-científica da pesquisa e pós-graduação da Amazônia Sul-Ocidental
Período: 2017 - 2018 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA - [COORDENADOR] FAPERO PÓS-DOC 007/2016. Engenharia de peptídeos miméticos inspirados em bioativos de venenos de serpentes do gênero Bothrops
Concessão de uma Bolsa de Pós-Doutoramento pelo período de 12 meses, renovável por mais 12 meses.
Período: 2016 - 2018 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: DESENVOLVIMENTO - IX SEMINÁRIO INTEGRADO DE PÓS-GRADUAÇÃO E PESQUISA (SEMPP) & II SIMPÓSIO DE INOVAÇÃO, PROPRIEDADE INTELECTUAL E TRANSFERÊNCIA DE TECNOLOGIA (SINTEC)
Período: 2018 - 2018 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: OUTRA - [COORDENADOR] FAPERO Nº 06/2014 - MS/DR. A HERPETOFAUNA EM UMA DAS ÁREAS PRIORITÁRIAS PARA A CONSERVAÇÃO DA BIODIVERSIDADE NO SUDOESTE DA AMAZÔNIA BRASILEIRA
Período: 2015 - 2018 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: DESENVOLVIMENTO - [COORDENADOR] Distribuição vertical de potenciais vetores envolvidos na transmissão da malária símia e de arboviroses em três localidades no estado de Rondônia, Amazônia Ocidental, Brasil
As mudanças ambientais produzidas pelo homem podem afetar a distribuição espacial e temporal dos vetores de doenças, com adaptação de patógenos e vetores a novos ciclos de transmissão e manutenção das doenças. No estado de Rondônia foram observadas taxas de infecção relativamente altas (10,3%) por Plasmodium brasilianum em várias espécies silvestres de símios; infecções naturais por P. falciparum também foram registradas. Concomitantemente, existe uma grande diversidade de vírus transmitidos por artrópodes na região Amazônica, mas pouco se sabe quanto os aspectos epidemiológicos das arboviroses, com exceção da febre do DENV. Algumas arboviroses e a malária símia compartilham a questão do conhecimento limitado acerca da identidade dos vetores que participam do ciclo de transmissão dos patógenos. Dessa forma, os objetivos da proposta são comparar a frequência de espécies de Anophelinae e Culicinae (Culicidae) e Ceratopogonidae (i) em copa e solo de floresta, verificando espécies com comportamento acrodendrofílico; (ii) em função do tipo de armadilha empregada (CDC e BG-Malária®); estimar as taxas de infecção natural por (iii) P. falciparum, P. vivax, P. malariae/P. brasilianum e P. simium em espécies do gênero Anopheles; (iv) vírus Dengue, Oropouche, da Febre Amarela, Mayaro, Cacipacoré e da febre do Nilo Ocidental em dípteros silvestres com potencial para transmissão de arbovírus. Como resultados, esperamos que a distribuição estratificada de muitas espécies de mosquitos e ceratopogonídeos resultem numa estratificação dos patógenos por elas veiculados. Altas taxas de infecção natural por P. brasilianum seriam verificadas nas copas em espécies de Anopheles tipicamente acrodendrofílicas. No solo, P. vivax e P. falciparum predominariam. Espera-se também altas taxas de P. falciparum nas copas de árvores. Quanto aos arbovírus, esperamos encontrar o vírus da febre amarela e vírus Cacipacoré, com ciclos tipicamente silvestres, em vetores situados nas copas, apresentando maiores taxas de infecção neste ambiente
Período: 2015 - 2017 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA - VIII SEMINÁRIO INTEGRADO DE PÓS-GRADUAÇÃO E PESQUISA (SEMPP) & I SIMPÓSIO DE INOVAÇÃO, PROPRIEDADE INTELECTUAL E TRANSFERÊNCIA DE TECNOLOGIA (SINTEC)
Período: 2017 - 2017 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: OUTRA - [COORDENADOR] FAPERO Nº 05/2014 ? IC. Caracterização de bioativos de venenos de Anuros e Serpentes da Amazônia
Período: 2015 - 2017 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: DESENVOLVIMENTO - [COORDENADOR] Métodos moleculares e clássicos aplicados à identificação e caracterização de novos compostos químicos ativos contra malária e leishmaniose à partir da biodiversidade
O projeto tem o objetivo de identificar, isolar e produzir, em nível experimental, protótipos de novas drogas derivadas de moléculas de origem vegetal, animal e microbiana oriundas da biodiversidade brasileira, ou especificamente sintetizadas, ativas contra alvos moleculares de vias metabólicas particulares de parasitas da malária e das leishmanioses humanas e de seus respectivos vetores insetos. O material de partida para o screning serão extratos de plantas, secreções de animais e metabólitos secretados por micorganismos endofíticos ou Actinomyces raros e também compostos produzidos ou modificados por síntese química. A atividade anti-parasitária e/ou anti-vetorial dos produtos detectados e purificados por ressonância plasmônica de superfície (SPR) ou purificados classicamente, será analisada diretamente em modelos de culturas celulares e em infecções experimentais in vivo, quando ensaiada contra os parasitas, ou contra os vetores respectivos em suas diferentes fases de desenvolvimento. Paralelamente serão realizados experimentos de screenig virtual, docking e dinâmica molecular para identificação de substâncias capazes de interagir com o centro ativo das enzimas alvo, os compostos identificados serão adquiridos de coleções já disponíveis e testados quanto as suas reais capacidades de inibição das enzimas e em casos positivos na diminuição/eliminação da parasitemia em ensaios em cultura de células e em ensaios em culturas ou em animais. Os Protótipos eleitos servirão igualmente de base para síntese de compostos químicos derivados que também serão testados quanto suas atividades anti-parasitárias. Em resumo, o objetivo final do projeto é gerar pelo menos um Protótipo para cada alvo (anti-malárico e anti-leishmaniose), devidamente estudado em fase pré-clínica e registrado em patente que possa ser encaminhado a ensaios clínicos futuramente, gerando conhecimento e difusão tecnológica com viabilidade econômica para o país.
Período: 2015 - 2016 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA - Prospecção, caracterização e prototipagem de agentes de ação antimalárica e inseticida a partir da biodiversidade da Amazônia legal
O presente projeto tem o objetivo identificar, isolar e produzir, em nível experimental, protótipos de novas drogas derivadas de moléculas de origem vegetal, animal e microbiana oriundas da biodiversidade brasileira, ou especificamente sintetizadas, ativas contra alvos moleculares de vias metabólicas particulares de parasitas da malária humana e de seus respectivo vetor inseto, o Anopheles darlingi. O material de partida para o screening serão extratos de plantas, secreções e venenos de animais, metabólitos secretados por microrganismos endofíticos e actinomicetos oriundos em sua maioria da biodiversidade amazônica, e também compostos produzidos ou modificados por síntese química. A atividade anti-parasitária e/ou anti-vetorial dos produtos desenvolvidos, sejam estes obtidos por purificação clássica, detectados e isolados por ressonância plasmônica de superfície (SPR), ou sintetizados, serão analisados in vitro na forma livre ou nanoencapsulados utilizando-se modelos de culturas celulares, e em infecções experimentais in vivo, quando testados contra os parasitas, ou contra os vetores respectivos em suas diferentes fases de desenvolvimento. Paralelamente serão realizados experimentos de screenig virtual, utilizando ferramentas de docking e dinâmica molecular para identificação de substâncias capazes de interagir com o centro ativo de enzimas identificadas com alvos validados, onde serão utilizadas estruturas moleculares conhecidas depositadas em bancos de dados disponíveis, que serão adquiridas por fornecedores comerciais para realização de testes quanto suas reais capacidades de inibição das enzimas e potencial diminuição/eliminação da parasitemia em ensaios in vitro e in vivo. Os protótipos serão desenvolvidos a partir das moléculas líderes indentificadas que servirão de base para a síntese de compostos químicos variantes que também serão testados quanto suas atividades anti-parasitárias. Em resumo, o objetivo da presente proposta é gerar protótipos anti-maláricos e inseticidas devidamente estudados em fase pré-clínica e registrados em patentes que possam ser encaminhados a ensaios de caracterização toxicológica e futuros testes clínicos, gerando consequentemente conhecimento e difusão tecnológica com viabilidade econômica para o país
Período: 2013 - 2016 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA - PROGRAMA REDE-NANOBIOTEC-BRASIL: Desenvolvimento nanobiotecnológico de produtos (drogas ou sensores diagnóstico) para o combate de doenças negligenciadas com especial ênfase em Leishmaniose e Malaria falciparum
A proposta apresentada a seguir pode ser enquadrada como desenvolvimento de nanobiotecnologia associada à bioprodutos destinados ao uso terapêutico em doenças negligenciadas a partir da biodiversidade amazônica (produtos vegetais ou toxinas animais) e a associação destes com sistemas de carreamento nanoestruturados (lipossoma, proteolipossoma ou sistemas poliméricos sintéticos) e proteínas relevantes imunoprotetoras. A abordagem moderna de desenvolvimento de medicamentos para doenças mais complexas, sobretudo as doenças endêmicas negligenciadas, como a malária e a leishmaniose, está baseada no uso de alvos moleculares definidos e mecanismos de nanodispersão de drogas. Entre outras vantagens, esta abordagem (i) permite encontrar moléculas líderes com mecanismos de ação definidos no alvo desejado, (ii) permite a análise de um grande número de compostos vindos da biodiversidade (toxinas ou bioativos de plantas) por um custo/benefício favorável, (iii) possibilita, já nos primeiros estágios, o desenvolvimento de fármacos com toxicidade seletiva (princípio básico da quimioterapia), (iv) permite avaliar o nível de dispersão controlada de drogas através de nanoparticulas e nanosensores lipossomais ou nanoestruturas e, (v) avaliar o perfil imunomodulador do hospedeiro, para confecção de vacinas e imunoterapia, à partir de proteínas antigênicas relevantes do parasita. O domínio destas abordagens está no momento concentrado nos países desenvolvidos, em especial nas grandes indústrias farmacêutica e é considerado o ponto mais relevante no desenvolvimento de fármacos por nanobiotecnologia. Tal fato contribui de forma significativa para a ausência de medicamentos inovadores para o tratamento das doenças dos países em desenvolvimento, sobretudo para as doenças negligenciadas e, mecanismos de diagnósticos mais efetivos
Período: 2009 - 2015 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA - Métodos moleculares e clássicos aplicados à identificação e caracterização de novos compostos químicos ativos contra malária e leishmaniose à partir da biodiversidade
O projeto tem o objetivo de identificar, isolar e produzir, em nível experimental, protótipos de novas drogas derivadas de moléculas de origem vegetal, animal e microbiana oriundas da biodiversidade brasileira, ou especificamente sintetizadas, ativas contra alvos moleculares de vias metabólicas particulares de parasitas da malária e das leishmanioses humanas e de seus respectivos vetores insetos. O material de partida para o screning serão extratos de plantas, secreções de animais e metabólitos secretados por micorganismos endofíticos ou Actinomyces raros e também compostos produzidos ou modificados por síntese química. A atividade anti-parasitária e/ou anti-vetorial dos produtos detectados e purificados por ressonância plasmônica de superfície (SPR) ou purificados classicamente, será analisada diretamente em modelos de culturas celulares e em infecções experimentais in vivo, quando ensaiada contra os parasitas, ou contra os vetores respectivos em suas diferentes fases de desenvolvimento. Paralelamente serão realizados experimentos de screenig virtual, docking e dinâmica molecular para identificação de substâncias capazes de interagir com o centro ativo das enzimas alvo, os compostos identificados serão adquiridos de coleções já disponíveis e testados quanto as suas reais capacidades de inibição das enzimas e em casos positivos na diminuição/eliminação da parasitemia em ensaios em cultura de células e em ensaios em culturas ou em animais. Os Protótipos eleitos servirão igualmente de base para síntese de compostos químicos derivados que também serão testados quanto suas atividades anti-parasitárias. Em resumo, o objetivo final do projeto é gerar pelo menos um Protótipo para cada alvo (anti-malárico e anti-leishmaniose), devidamente estudado em fase pré-clínica e registrado em patente que possa ser encaminhado a ensaios clínicos futuramente, gerando conhecimento e difusão tecnológica com viabilidade econômica para o país
Período: 2010 - 2015 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA - 550854/2010-0 Banco de Venenos e Secreções da Amazônia Sul Ocidental e Oriental: ampliação e caracterização molecular para a geração do conhecimento bioprospectivo à biotecnologia aplicada ao desenvolvimento de novos fármacos
A proposta possui o objetivo de gerar subsídios importantes no conhecimento bioprospectivo e biotecnológico tendo-se como base a biodiversidade de venenos e secreções da floresta amazônica, nos biomas presentes nos estados de Rondônia, Acre e Tocantins. A floresta amazônica representa a maior diversidade de espécies de répteis e anfíbios do território brasileiro. No entanto, o conhecimento científico, nos campos da ecologia, biogeografia e, sobretudo, da composição molecular e dos efeitos fisiológicos dos componentes isolados de venenos e secreções da maioria absoluta destas espécies é desconhecido. Principalmente nas regiões de estudo a serem propostas nesta demanda. Moléculas ativas provindas da natureza como metabólitos secundários de origem vegetal, peptídeos e toxinas animais, principalmente as de baixa massa molecular, representam a base tecnológica para o desenho de novos fármacos através da síntese química combinatorial. Apesar do Brasil possuir a maior biodiversidade do planeta, não existe nenhum relatado na literatura de proposta de fármaco original gerado genuinamente pelo conhecimento biotecnológico brasileiro centrado em sua biodiversidade. A formação de rede para incrementar o banco de venenos e secreções, além de proporcionar o aumento do conhecimento científico prospectivo de espécies de serpentes e anfíbios, muitas delas desconhecidas, também criará subsídios químicos através de análises estruturais da composição dos venenos e secreções coletadas utilizando-se de técnicas de genômica e proteômica, para investidas no processamento biotecnológico para desenvolvimento de protótipo de produto. Portanto, a proposta apresentada a seguir, pode ser considerada inovadora por buscar associar os conhecimentos ecológicos prospectivos, gerados por expedições científicas em pontos estratégicos, e fisiopatológicos dos venenos e secreções coletados, gerados por proteômica funcional provenientes das análises do banco de dados de moléculas purificadas ou semi-purific
Período: 2010 - 2015 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA - 554307/2010-3 Moléculas com potencial antifúngico em sementes, folhas e casca de espécies arbóreas: Bioprospecção, uso e sustentabilidade da flora amazônica
O projeto intitulado Moléculas com potencial antifúngico em sementes, folhas e casca de espécies arbóreas: Bioprospecção, uso e sustentabilidade da flora amazônica tem aptidão multi e interdisciplinar, reunindo competências desde áreas aplicadas das ciências florestais (melhoramento florestal, manejo florestal, patologia florestal) com ênfase no uso e na sustentabilidade de espécies arbóreas, até profissionais das áreas de fitopatologia, fisiologia vegetal, bioquímica, química, botânica e biotecnologia. Portanto, enquadrando de maneira coerente as linhas de atuação de todos os profissionais (17 doutores e 13 estudantes de mestrado e doutorado) envolvidos na proposta, elaborou-se um projeto com foco na prospecção e na sustentabilidade de produtos florestais a partir da busca sistemática de biomoléculas que estejam relacionadas à fitoproteção durante processos fisiológicos vitais para as espécies (mobilização de metabólitos primários durante a germinação de sementes e produção de metabólitos secundários, como óleos essenciais nas folhas e cascas) e/ou analisando processos bioquímicos específicos como a síntese de proteínas de defesa (estudos sobre lectinas e inibidores de proteinases em sementes) de espécies arbóreas da flora Amazônica que possam resultar em bioprodutos (obtenção de moléculas com atividade antifúngica), além de contribuir para o entendimento de bioprocessos com ênfase na conservação e no uso da diversidade florestal (germinação de sementes, produção de óleos essenciais, cultivo in vitro, proteção fitossanitinária de plantas em viveiro). Com esta perspectiva, no âmbito do projeto principal acima mencionado, três subprojetos foram elaborados conjuntamente visando objetivo comum de prospectar potenciais moléculas antifúngicas em diferentes tecidos vegetais de espécies arbóreas da Amazônia. Valor: R$ 1.116.000,00
Período: 2010 - 2014 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA - [COORDENADOR] CNPq 556898/2009-5: Capacitação de Recursos Humanos em Bioprospecção e Biotecnologia para o Desenvolvimento da Amazônica Sul Ocidental - Rondônia.
Formar pesquisadores qualificados na utilização de ferramentas bioquímicas, biofísicas, moleculares e prospectivas no desenvolvimentos de projetos de desenvolvimento biotecnológico da biodiversidade amazônica. Expandir o Banco Venenos de Animais da Amazônia com amostras de venenos liofilizados e congelados a -86 oC de anuros e serpentes de espécies do Acre e Rondônia. Purificar e caracterizar peptídeos bioativos das espécies de phyllomedusas amazônicas (P. atelopoides, P. palliata, P. vaillantii, e P. tarsius) que não possuem a descrição do peptídeos existentes em suas secreções cutâneas. Adicionalmente, purificar e caracterizar peptídeos bioativos de amostras provenientes de outras espécies pertencentes as famílias Bufonidae, Dendrobatidae, Hylidae, Leptodactylidae e Microhylidae presentes no Banco de Venenos de Animais da Amazônia incluindo peptídeos de veneno de Bothrops atrox. Submeter peptídeos purificados e amostras de veneno bruto para realização de testes antimicrobianos contra Leishmania spp in vitro e P. falciparum.
Período: 2009 - 2012 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA - [COORDENADOR] CT-Amazônia/CNPq 575669/2008-0: Implantação do Banco de Venenos de Anuros do IPEPATRO para a prospecção da biodiversidade molecular da anurofauna da Amazônia Ocidental visando a descoberta de novos peptídeos antimicrobianos
Compor um Banco Venenos de Anuros liofilizados e congelados a -86 o C com aproximadamente duzentas espécies do Acre e Rondônia e purificar e caracterizar peptídeos bioativos
Período: 2009 - 2012 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA - [COORDENADOR] UNIVERSAL/CNPq 483546/2010-0: Prospecção de peptídeos e proteínas da anurofauna amazônica visando à identificação de candidatos para o desenvolvimento de novos antiparasitários
As secreções cutâneas das glândulas granulosas e paratoides de diversas espécies de anuros têm sido reveladas como interessantes fontes de bioativos com atividade antiparasitária (peptídeos e esteroides), no entanto, a grande maioria dos resultados tem sido obtidos com animais africanos, europeus, asiáticos, e alguns americanos, em especial, dos biomas cerrado e mata atlântica. Os animais do bioama amazônico ainda foram pouco estudados quanto à perspectiva de descoberta de moléculas com potencial para serem candidatos para o desenvolvimento de novos antiparasitários, entre outras potencias aplicações para a saúde humana. Nesta perspectiva, propomos desenvolver a caracterização de peptídeos antimicrobianos anuros pertencentes a espécies e gêneros ainda não pesquisados. Considerando que a pressão evolutiva exercida pelas relações presa-predador e hospedeiro-parasita são potencializadas no bioma amazônico, acreditamos que há grande potencial para descrição de novas de famílias peptídeos antimicrobianos, além de novas especializações em peptídeos de famílias conhecidas quando encontrados em animais deste bioma. Devido às condições técnicas proporcionadas pela aquisição do MALDI-TOF/TOF AXIMA TOF2 (Shimadzu/Kratus UK), Ressonância Plasmônica Biacore T100 e dois AKTA Purifier (GE Healthcare) pelo CEBio, somadas a obtenção das autorizações emitidas pelos órgãos ambientais reguladores no presente ano, para a execução da coleta e acesso ao patrimônio genético dos anuros nos Estados de Rondônia e Acre, propomos no presente projeto o apoio a uma sólida equipe de bolsistas formada para a realização de coletas e identificação de anuros, estudo do peptidoma de espécies amazônicas, síntese de peptídeos caracterizados a realização de ensaios de atividade de peptídeos contra Leishmania amazonensis e Plasmodium falciparum, visando a caracterização da atividade biológica, além do fortalecimento do programa de mestrado e doutorado em Biologia Experimental
Período: 2010 - 2012 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA - [COORDENADOR] FINEP Ref.: 0200/12. PROINFRA: Alavancagem e modernização da Infra-estrutura Científica e Tecnológica na Amazônia Sul-Ocidental ? Rondônia
O presente projeto visa dotar o CEBio de mais moderna tecnologia de espectrometria de massa (hybrid Qq-oaTOF mass spectrometer) para que este grupo de pesquisa possa caracterizar peptídeos bioativos, proteínas e produtos naturais da Biodiversidade Amazônica. Contempla a aquisição de um Espectrômetro de Massa Xevo G2S QTof Waters para sequenciamento de peptídeos e caracterização de proteínas, além de um Zetasizer Nano ZS para a mensuração do tamanho, massa molecular e potencial zeta e partículas dispersas em solução. Valor Apoiado: R$ 1.366.570,00
Período: 2012 - 2012 / Situação: DESATIVADO / Natureza: PESQUISA - MCT/FINEP/CT-INFRA-PROINFRA-01/2007: Compra de Equipamentos Biofísicos e Pequenas Reformas Civil para Modernização Final do CEBIO. Valor Aprovado: R$ 392.430,00
A proposta possui como objetivo geral promover melhorias de infra-estrutura à partir de pequenas obras físicas civil (instalação de janelas, climatização, instalação elétrica) e compra de equipamentos para o Centro de Estudos Biomoleculares (CEBIO) do Laboratório de Bioquímica e Biotecnologia da UNIR/IPEPATRO. Objetivo científico: Melhoramento do espeço físico que integra a rede de laboratórios envolvidos em três grandes temáticas na pesquisa de doenças tropicais oficializadas pelo Instituto do Milenium e Rede Genoprot Finep 2007: (i) a identificação de compostos naturais, incluindo o desenvolvimento de compostos químicos deles derivados, presentes em plantas bioativas selecionadas da biodiversidade brasileira com atividade contra Plasmoduim, Leishmaniose, Eimeria sp, ou com atividade contra toxinas animais com especial enfase em toxinas de venenos de serpentes e anuros; (ii) Produção e caracterização de particulas nanoestruturadas (nanoparticulas ou lipossomas) para o desenvolvimento de fármacos alvo específico ou imunomodulares para o tratamento de Leishmaniose e malaria; e (iii) Sintese gênica de moleculas de rotas específicas do metabolismo Plasmodium capazes de atribuir inibição específica para tratamento ou uso em diagnóstico rápido.
Período: 2008 - 2011 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA - [COORDENADOR] FDCT/FUNTAC: Prospecção da biodiversidade molecular da anurofauna acreana visando a descoberta de peptídeos bioativos aplicáveis a leishmaniose e malária visando o desenvolvimento de bioprodutos para a saúde humana. R$ 25.000,oo
Capacitar a Universidade da Floresta a purificar e caracterizar peptídeos bioativos de espécies de anuros do gênero Phyllomedusa do Alto Juruá, para a realização de ensaios antimicrobianos contra fungos dermatofíticos resistentes, Plasmodium falciparum e Leishmania spp, como forma de gerar subsídios para desenvolvimento de novos fármacos a partir da biodiversidade molecular acreana.
Período: 2008 - 2011 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA - PROGRAMA GENOPROT: Proteômica funcional para elaboração de ferramentas biotecnológicas para tratamento de doenças tropicais com especial enfase em malaria e leishmaniose. Verba Aprovada: R$ 769.547,36
Fundamentação da rede de estudo de proteômica funcional para análise de rotas alternativa metabólicas e moléculas carreadoras de fármacos específicos e o estudo de moléculas de origem peptídica de venenos de serpentes a anuros, ambos muito pouco estudados na região norte do país, para a aplicação e desenvolvimento de terapêutica
Período: 2008 - 2010 / Situação: EM_ANDAMENTO / Natureza: PESQUISA - CNPq/PRONEX: Análise Proteômica e de substancias naturais para a construção de Sistemas nanoestruturados (lipossomais ou poliméricos) de liberação de drogas e de proteínas antigênicas de Plasmodium sp e Leishmania sp
Verba Aprovada: R$ 890.000. A abordagem moderna de desenvolvimento de medicamentos para doenças mais complexas, sobretudo as doenças endêmicas negligenciadas, como a tuberculose, malária e leishmanioses, está baseada no uso de alvos moleculares definidos e mecanismos de dispersão de drogas.
Período: 2008 - 2010 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA - Rede Nacional de Biologia Molecular Estrutural - RENABIME/LNLS
Período: 2003 - 2006 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA - Projeto Universal/CNPq - Estabilidade estrutural de inibidores de serinoproteases
Este projeto visa purificar e caracterizar inibidores de serinoproteases quanto a estabilidade estrutural, bem como a determinação da estrutura tridimensional
Período: 2003 - 2005 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA - Structural study of protease inhibitors: Development of a system for protein crystallization
Estabelecimento da infraestrutura básica para utilização da técnica de cristalização de proteínas. Obtenção de cristais de proteínas, principalmente dos inibidores de serinoproteases, para posterior análise e determinação da estrutura tridimensional em centros de difração de raios-X
Período: 1998 - 2004 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA
Áreas de Atuação
- CIENCIAS_BIOLOGICAS :: Biofísica :: Biofísica Molecular ::
- CIENCIAS_BIOLOGICAS :: Bioquímica :: Bioquímica Estrutural ::
- CIENCIAS_BIOLOGICAS :: Bioquímica :: Química de Macromoléculas :: Proteínas
- CIENCIAS_BIOLOGICAS :: Zoologia :: Biodiversidade ::
Idiomas
- Inglês: Lê: BEM, Fala: BEM, Escreve: BEM, Compreende: BEM
Banca Julgadora
| Tipo de Produção | < | Total |
|---|---|---|
| Banca Julgadora para Concurso Público | 6 | 6 |
| Participação em Banca de Doutorado | 7 | 7 |
| Participação em Banca de Exame de Qualificação | 2 | 2 |
| Participação em Banca de Graduação | 6 | 6 |
| Participação em Banca de Mestrado | 7 | 7 |
| Total | 28 | 28 |
Eventos
| Tipo de Produção | < | 2024 | Total |
|---|---|---|---|
| Participação em Congresso | 19 | 0 | 19 |
| Participação em Encontro | 6 | 0 | 6 |
| Participação em Seminário | 11 | 0 | 11 |
| Participação em Simpósio | 13 | 1 | 14 |
| Total | 49 | 1 | 50 |
Orientação
| Tipo de Produção | < | 2020 | 2021 | 2022 | Total |
|---|---|---|---|---|---|
| Orientação em Andamento de Doutorado | 2 | 0 | 2 | 0 | 4 |
| Orientação em Andamento de Mestrado | 0 | 0 | 1 | 0 | 1 |
| Orientações Concluídas para Doutorado | 8 | 1 | 0 | 1 | 10 |
| Orientações Concluídas para Mestrado | 13 | 0 | 0 | 2 | 15 |
| Orientações Concluídas para Pós-Doutorado | 4 | 0 | 0 | 1 | 5 |
| Outras Orientações Concluídas | 34 | 1 | 0 | 0 | 35 |
| Total | 61 | 2 | 3 | 4 | 70 |
Prêmios
| Tipo de Produção | < | 2021 | 2023 | Total |
|---|---|---|---|---|
| Prêmios | 5 | 3 | 2 | 10 |
| Total | 5 | 3 | 2 | 10 |
Produção Bibliográfica
| Tipo de Produção | < | 2020 | 2021 | 2022 | 2024 | Total |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Artigo Publicado | 67 | 4 | 2 | 5 | 2 | 80 |
| Capitulo de Livro Publicado | 3 | 0 | 0 | 1 | 0 | 4 |
| Curso de Curta Duração Ministrado | 6 | 0 | 0 | 0 | 0 | 6 |
| Desenvolvimento de Material Didático ou Institucional | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 4 |
| Editoração | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 3 |
| Livro Publicado ou Organizado | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 2 |
| Organização de Evento | 5 | 0 | 0 | 0 | 0 | 5 |
| Outras Participações em Eventos e Congressos | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 |
| Outras Produções Bibliográfica | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| Programa de Rádio ou TV | 3 | 3 | 0 | 0 | 0 | 6 |
| Texto em Jornal ou Revista | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 4 |
| Trabalho em Eventos | 124 | 3 | 0 | 1 | 0 | 128 |
| Total | 223 | 10 | 2 | 8 | 2 | 245 |
Produção Técnica
| Tipo de Produção | < | 2020 | Total |
|---|---|---|---|
| Mídia Social, Website ou Blog | 1 | 0 | 1 |
| Patente | 7 | 1 | 8 |
| Prefacio Posfacio | 1 | 0 | 1 |
| Produto Tecnologico | 3 | 0 | 3 |
| Trabalho Técnico | 14 | 0 | 14 |
| Total | 26 | 1 | 27 |
Parceiros
