Bionorte em Números

Citações	SILVA, G. F.;Silva, G.F.;DA SILVA, GILVAN F;Ferreira da Silva, G.;SILVA, GILVAN FERREIRA;da Silva, G. F.;DA SILVA, G.F.;SILVA, GILVAN FERREIRA DA;DA SILVA, GILVAN FERREIRA;DA SILVA, GILVAN F.;SILVA, GILVAN F.;FERREIRA DA SILVA, GILVAN;DA SILVA, GILVAN
Titulação	Pós-Doutorado
Área	CIENCIAS_BIOLOGICAS :: Microbiologia

• Pós-Doutorado - Periodo: 2015 a 2016 - Rothamsted Research
• Pós-Doutorado - Periodo: 2009 a 2010 - Wageningen Univ.Res.-Plant Research International
• Doutorado - Periodo: 2003 a 2007 - Microbiologia Agrícola
  Universidade Federal de Viçosa
• Mestrado - Periodo: 2001 a 2003 - Genética e Melhoramento de Plantas
  Universidade Federal de Lavras
• Graduação - Periodo: 2019 a atual - Psicologia
  Centro Universitário do Norte
• Graduação - Periodo: 1995 a 1999 - Ciências Biológicas Licenciatura
  Universidade Federal de Sergipe

• Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico- / Periodo: 2017 a atual
• Embrapa Amazônia Ocidental- / Periodo: 2019 a atual
• Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária- / Periodo: 2007 a atual
• FOREST PATHOLOGY- / Periodo: 2018 a atual
• Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia- / Periodo: 2014 a atual
• JOURNAL OF PLANT PATHOLOGY- / Periodo: 2018 a atual
• PLANT DISEASE- / Periodo: 2017 a atual
• Universidade Federal de Sergipe- / Periodo: 2000 a 2001
• Universidade Federal de Viçosa- / Periodo: 2004 a 2004
• Universidade Federal do Amazonas- / Periodo: 2013 a atual

• Edição gênica
• Edição Gênica de microrganismos com potencial biotecnológico
• Filogenia e Taxonomia microrganismos de interesse agrícola
• Genética Bioquímica
• Genômica aplicada a agropecuária
• Genômica aplicada a mineração de produtos de produtos naturais
• Genômica e Biologia molecular - Taxonomia biológica de microrganismos -Biotecnologia de microrganismos - Edição Gênica
• Mineração gênica e prospecção de produtos do metabolismo secundário microbiano
• Taxonomia e Filogenia microbiana
• Taxonomia microbiana de fungos e bactérias com potencial biotecnológico

• Produção animal e vegetal sustentável como base para o desenvolvimento agrícola na amazônia
  EDITAL: CAPES-AMAZONIA-LEGAL- O projeto soma-se aos esforços em andamento e permitirá o fortalecimento do PPG-ATU tanto quantitativo, quanto qualitativo na formação de recursos humanos, produção técnico-científica e desenvolvimento de soluções sustentáveis para a Amazônia na área de produção animal e vegetal. Na atual proposta, seis ações para consolidação do PPG-ATU na linha temática de produção animal e vegetal sustentável serão implementadas: 1-Amplição da formação de recursos humanos de alto nível no Amazonas; 2-Desenvolvimento de alternativas sustentáveis para sistema integrado de produção agroecológico das principais cadeias produtivas vegetais da Amazônia; 3-Fortaleceimento da linha de pesquisa uso, manejo e tecnologia de recursos tropicais por meio da implantação de pesquisas em produção animal sustentável voltadas as cadeias aquícolas do Amazonas; 4-Prospecção de microrganismos produtores de moléculas de interesse agrotecnológico e/ou com potencial para o desenvolvimento de bioprodutos aplicados na produção animal e vegetal; 5-Criação de programas de divulgação voltado socialização do conhecimento científico e dos resultados de pesquisa do PPG-ATU; 6-Capacitação e transferências de tecnologias aos produtores do estado do amazonas para melhoria da produção animal e vegetal. Qualitativamente, serão estabelecidas ações para melhoria na formação dos estudantes nas áreas de produção animal e vegetal sustentável como: inclusão de novas disciplinas e cursos de curta duração relacionadas ao temas; elaboração de disciplinas conjuntas com participação de docentes locais, pós-doutores e pesquisadores externos que sejam referência nacional e internacional na área; mobilidade acadêmica de estudantes (via Procad-AM) para grupos de alto nível (parceiros nível 6 e 7 na CAPES) permitindo o contato direto dos estudantes com cursos nível internacional.
  Período: 2021 - atual / Situação: EM_ANDAMENTO / Natureza: PESQUISA
• FEEDBACKS PLANTA-SOLO NA FLORESTA AMAZÔNICA E EM SISTEMAS AGRÍCOLAS NO ESTADO DO AMAZONAS
  CHAMADA PÚBLICA N. 001/2020 - FAPESP - FAPEAM A mudança do uso do solo na floresta amazônica e sua conversão em pastagens provoca a degradação do ecossistema. Após a conversão de floresta em pastagem se inicia o processo de degradação agrícola e biológica. Na degradação agrícola a pastagem vai diminuindo sua produtividade e aumenta a infestação de plantas indesejáveis. Na degradação biológica, as plantas das pastagens diminuem o vigor drasticamente, consequência da redução de nutrientes disponíveis no solo. Observa-se também um aumento da erosão e da compactação do solo com pastagem. Com a degradação biológica ocorre também degradação da biodiversidade e alteração na atividade e quantidade de microrganismos no solo, que impactam diretamente em diferentes ciclos de nutrientes como carbono e nitrogênio. Durante a degradação biológica, ocorre uma aceleração de processos de mineralização e degradação da matéria orgânica. A aceleração desses processos aumenta as emissões de gases de efeito estufa, que são a maior contribuição brasileira nas emissões de gases de efeito estufa e no aumento do aquecimento global. Essas mudanças no clima, têm impacto direto nas atividades econômicas e no bem-estar da humanidade. Deve-se observar que os processos físicos, químicos e biológicos no solo contribuem para uma interação constante entre planta e solo. Os efeitos desses processos nessa interação são denominados feedbacks planta-solo. O conhecimento desse feedback é crítico para restaurar a biodiversidade vegetal e as propriedades do ecossistema. A mudança do uso do solo na Amazônia modificou as suas propriedades originais e isso tem influência direta sobre a restauração florestal em áreas degradadas. A relação planta solo foi demonstrada em diferentes florestas tropicais e temperadas, mas há pouco conhecimento relacionado ao feedback planta-solo nesses ecossistemas Amazônicos. Assim, o objetivo deste trabalho será avaliar os feedbacks planta-solo na floresta amazônica e em sistemas agrícolas no estado do Amazonas.
  Período: 2021 - atual / Situação: EM_ANDAMENTO / Natureza: PESQUISA
• PROCAD AmazonMicro- Prospecção de moléculas e desenvolvimento de produtos e/ou processos biotecnológicos
  EDITAL Nº 21/2018- PROGRAMA NACIONAL DE COOPERAÇÃO ACADÊMICA NA AMAZÔNIA É de conhecimento geral que as dificuldades inerentes à região norte como acessibilidade, logística e assimetria nos índices de desenvolvimento humano e educacional, são barreiras a serem superadas para que o potencial biotecnológico da região seja efetivamente identificado, estudado, analisado e utilizado em prol do desenvolvimento regional e da sociedade brasileira. Dentro deste contexto, o programa de pós-graduação em Agricultura no Trópico Úmido (PPG-ATU) tem participado em vários projetos que foram ou estão sendo implementados visando a caracterização da microbiota amazônica, bem como a prospecção de moléculas e desenvolvimento de produtos e processos voltados à agricultura. Entre estes, podemos destacar os projetos: 1 - MICROOMA- microbiomas amazônicos: uma abordagem para sustentabilidade e prospecção de bioativos, 2 - Identificação e obtenção de moléculas com aplicação biotecnológica com base na microbiota amazônica (em implementação), 3 - Identificação e análise de moléculas e vias metabólicas com potencial biotecnológico em duas novas espécies de Arcopilus isoladas de guaranazeiro (em implementação). E nesta mesma linha de pesquisa, a PPG-ATU está coordenando esforços para a criação da rede interinstitucional de ensino e pesquisa AmazonMicro por meio de submissão de proposta ao edital Procad-Amazônia. Com base no cenário aqui descrito, a presente proposta vem somar esforços no estudo e utilização da microbiota amazônica. Este potencial aliado a qualificação de recursos humanos na região e ao uso de ferramentas químicas e ?ômicas? são fatores fundamentais para a descoberta novos produtos naturais e desenvolvimento. Assim, a apresente proposta visa fortalecer, ampliar e consolidar o ensino e pesquisa em microbiologia por meio de parcerias interinstitucionais visando o desenvolvimento de produtos e processos com base na microbiota amazônica.
  Período: 2018 - atual / Situação: EM_ANDAMENTO / Natureza: PESQUISA
• Uso de microrganismos para desenvolvimento de soluções sustentáveis voltadas à agropecuária e fortalecimento da bioeconomia amazônica
  Edital Bioeconomia da Amazônia: Sistema Embrapa de Gestão (SEG-Embrapa Projeto Tipo II)No contexto agrícola, o Brasil destaca-se no cenário internacional não apenas pelo volume produzido, mas também pela alta quantidade de defensivos químicos, estando entre os maiores consumidores mundiais a mais de uma década. A substituição de defensivos químicos por produtos de origem biológica tem se mostrado uma alternativa ecologicamente sustentável, com menor toxicidade e menos chances de danos à saúde humana. Além disso, a alta demanda por bioinsumos e baixa disponibilidade de produtos comerciais (comparado aos convencionais) traz grandes oportunidades para o setor de produtos biológicos que apresentou aumento de 70 do capital movimentado no período de 2017 a 2019. Nesse sentido os microrganismos destacam-se pela sua ampla e diversificada capacidade metabólica que pode conferir às culturas vegetais tanto a defesa contra patógenos como o aumento na sua biomassa pela disponibilização de nutrientes como fosfato e nitrogênio, podendo ser também uma alternativa ao uso de fertilizantes químicos. Além disso, os metabólitos secundários de origem microbiana a exemplos dos peptídeos não ribossomais têm se mostrado promissores insumos voltados ao desenvolvimento de soluções agrícolas. Neste contexto esta proposta visa desenvolver biodefensivos, biofertilizantes e insumos de base microbiológica com foco no desenvolvimento agroindustrial sustentável. Três soluções de inovação são propostas no presente projeto, uma voltada ao desenvolvimento de biodefensivos, outra à promoção de crescimento vegetal e a terceira refere-se ao desenvolvimento de ativos tecnológicos a partir de produtos naturais e microrganismos geneticamente editados. Temos como diferenciais neste projeto o fato do CPAA e seus parceiros possuírem uma gama de sequências de peptídeos inéditos descobertos a partir da biodiversidade da microbiota amazônica, o uso de ferramentas ômicas (culturômica, genômica, transcriptômica, proteômica e metabolômica) combinada com biologia sintética de modo a permitir que os microrganismos utilizado no desenvolvimento de biodefensivos, biofertilizantes e para produção de insumos de interesse biotecnológico sejam: 1- submetidos a mineração genômica por meio de caracterização de BGCs (Biosynthetic gene clusters) para identificação de genes e vias metabólicas; 3- caracterizados quimicamente quanto ao metabolismo secundário e 4- submetidos a estudos de biodesign de modo a ampliar as potencialidades dos recursos genéticos microbianos relacionados a funções aplicáveis ao setor agroindustrial. Para tanto, uma equipe multidisciplinar distribuída em 10 estados brasileiros, formada por dezenas de pesquisadores de 9 unidades da Embrapa e 9 instituições de ensino e pesquisa. Como resultado para a primeira e segunda solução de inovação serão gerados ativos tecnológicos de origem biológica para substituição ou diminuição de insumos sintéticos (defensivos e fertilizantes químicos) a fim de contornar limitações produtivas da cultura da soja, arroz, banana, maracujá, feijão-caupi, cupuaçu e açaí. Para a terceira solução de inovação serão obtidos como resultado a obtenção de linhagens geneticamente melhoradas para a formulação de bioinoculantes de segunda geração com maior adaptabilidade a estresses bióticos e abióticos. Os impactos gerados por essas soluções de inovação incluem aumento de produtividade com menor impacto ambiental, melhoria na saúde e na qualidade de vida dos agricultores e consumidores, e consequente aumento na produtividade ao passo em que a inovação seja utilizada nas cadeias produtivas.
  Período: 2023 - atual / Situação: EM_ANDAMENTO / Natureza: PESQUISA
• Diversidade metataxonômica da microbiota de sedimentos de rios amazônicos em unidades de conservação e aplicação de abordagens metagenômicas para o desenvolvimento tecnológico sustentável por meio de identificação novos produtos naturais
  Edital Nº 007/2021 - BIODIVERSA/FAPEAM- A Amazônia é considerada o ambiente mais biodiverso do planeta. Dentre as espécies que compõem o bioma, fungos e bactérias desempenham um papel vital na reciclagem de nutrientes e manutenção desta floresta. As pesquisas e investimentos para o estudo sobre as espécies que compõem a diversidade amazônica de plantas e animais ainda são incipientes frente ao tamanho e complexidade da região. Este problema é mais grave quando nos referimos a microbiota, visto que estes são milhões de vezes mais abundantes e pouco explorados. Nos últimos anos, o grupo de pesquisa da Embrapa Amazônia Ocidental (CPAA) em parceria com diversas instituições da Amazônia legal e de outras regiões do Brasil, tem somado esforços no isolamento, identificação taxonômica, mineração de clusters gênicos biossintéticos (BGCs) relacionados a novos produtos naturais ou moléculas já conhecidas. Atualmente o CPAA conta com uma coleção composta por 746 bactérias e mais de 400 fungos isolados de sedimentos de cerca de 7 (sete) mil quilômetros de rios amazônicos (Madeira, Juruá, Purus e Solimões) sendo 30% em unidades de conservação (Reserva extrativista - RESEX do médio e baixo Juruá, Floresta Nacional - FLONA de Balata-tufari no rio purus, Reserva de desenvolvimento sustentável - RDS Piagaçu-purus e na RDS Mamirauá no rio Solimões) e ao nosso conhecimento esta é a maior amostra de sedimento dos rios amazônicos. As análises iniciais com microrganismos cultiváveis isolados desses sedimentos, tem permitido a identificação de dezenas de novas espécies de bactérias e fungos com potencial confirmado para o controle fitopatógenos de importância agrícola, patógenos humanos e de outros animais, além da produção de uma variada gama de enzimas de aplicação industrial, mostram o quanto a biodiversidade microbiana presente nos rios amazônicos pode ser útil para a bioeconomia. Embora os estudos com a microbiota cultivável já tenham revelado grande potencial biotecnológico, vale ressaltar que estimativas indicam que aproximadamente 1% dos microrganismos crescem em condições de laboratório, e até o momento devido a falta de recursos financeiros não foi possível explorar nem a biodiversidade, nem o potencial bioeconômico dos não cultiváveis por meio de abordagens multi-ômicas. Neste contexto, esta proposta visa descrever e analisar a composição da microbiota amazônica em unidades de conservação (UCs) por meio de análises de metataxonomia, bem como realizar mineração metagenômica buscando genes de interesse biotecnológicos visando o desenvolvimento da bioeconomia por meio de soluções tecnológicas inovadoras e ecologicamente sustentáveis, com consequente conscientização da necessidade de manutenção dos biomas amazônicos em virtude dos seus benefícios
  Período: 2022 - atual / Situação: EM_ANDAMENTO / Natureza: PESQUISA
• Microbiota Amazônica aplicada a prospecção e desenvolvimento de bioinsumos com foco nos setores agrícola, cosmético e farmacêutico
  DITAL N. 010/2021- CT&I ÁREAS PRIORITÁRIAS Considerada a maior biodiversidade do planeta, o bioma amazônico apresenta um potencial biotecnológico difícil de calcular ou até mesmo incalculável com relação ao valor agregado dos produtos naturais bioativos. O grupo de pesquisa da Embrapa Amazônia Ocidental em parceria com pesquisadores nacionais e internacionais tem nos últimos anos focado no isolamento e seleção de microrganismos isolados de diversos nichos ecológicos como plantas (endofíticos e patógenos), animais (simbiontes), rios (água e sedimentos) e solo da Amazônia. A construção destas coleções biológicas e triagens realizadas para diferentes aplicações, têm revelado grande potencial biotecnológico destes microrganismos relacionados à produção de enzimas com aplicação nas indústrias de alimentos e têxtil; 2- compostos bactericidas, fungicidas e antiparasitários; 3- inibição in vitro de patógenos de importância agrícola, bem como contra patógeno de interesse médico; e 4- atividade larvicida contra Aedes aegypti. Também foram identificadas dezenas de novas espécies que são uma fonte ainda inexplorada de produtos naturais. Este projeto une o isolamento e identificação de produtos naturais com uma abordagem em mineração gênica para vias do metabolismo secundário com base em genomas completos, identificação e caracterização de genes e vias metabólicas com potencial para a produção de compostos de interesse biotecnológico com a finalidade de atender as demandas de bioinsumos para as áreas agrícola (prospecção e aplicação de moléculas antimicrobianas frente a patógenos de interesse), farmacêutica (prospecção direcionada de novos antibióticos com diferentes modos de ação) e cosmética (prospecção de ectoína derivadas) por meio do sequenciamento de genoma completo de pelo menos 100 microrganismos e mineração genômica, visando uma prospecção direcionada e desenvolvimento de produtos e processos que auxiliem o desenvolvimento científico, econômico, social e ambiental no Estado do Amazonas.
  Período: 2022 - atual / Situação: EM_ANDAMENTO / Natureza: PESQUISA
• Desenvolvimento de bioinoculantes com base em microrganismos amazônicos com potencial para controle de patógenos de interesse agrícola, promoção de crescimento de plantas e indução de resistência
  Edital N. 008/2021 - PROSPAM/FAPEAM- Os microrganismos utilizados para o desenvolvimento de produtos de origem biológica ou também chamados de bioinsumos, são atualmente uma alternativa tecnológica para controle de patógenos de interesse agrícola e oferecem uma solução ecologicamente sustentável frente a pelo menos dois problemas: o primeiro, refere-se ao controle de fitopatógenos de importância regional, nacional e mundial, e o segundo o uso indiscriminado de defensivos agrícolas e os problemas de contaminação inerentes ao seu uso excessivo. O termo bioinsumo é considerado em sentido amplo qualquer processo ou tecnologia de origem vegetal, animal ou microbiana. Neste projeto o foco será dado ao desenvolvimento de soluções com base na microbiota isolada de diferentes ecossistemas amazônicos, visto que a biodiversidade no bioma amazônia apresenta potencial biotecnológico para o desenvolvimento de bioinsumos e outros produtos/processos aplicados a diversos setores da indústria relacionados à melhoria da qualidade de vida amazonense e seus aspectos econômicos, ambientais e sociais. Nesse contexto, o grupo de pesquisa da Embrapa Amazônia Ocidental em parceria com pesquisadores nacionais e internacionais tem nos últimos anos focado no isolamento e seleção de microrganismos isolados de diversos nichos ecológicos como plantas (endofíticos e patógenos), animais (simbiontes), rios (água e sedimentos) e solo da Amazônia. A triagem de microrganismos para o controle de diversos patógenos de importância agrícola para o estado do amazonas tem revelado grande potencial voltado para o desenvolvimento de bioinsumos com inibição de até 100% do crescimento in vitro de fitopatógenos como: Colletotrichum guaranicola, Fusarium decemcellulare, Corynespora cassiicola, Moniliophthora perniciosa e Pseudopestalotiopsis gilvanii que é novo patógeno recentemente descrito por nosso grupo de pesquisa como futura ameaça ao cultivo de guaranazeiro, açaí e dendê. Neste contexto, o objetivo deste projeto é desenvolver produtos sustentáveis a base de microrganismos amazônicos com potencial para o controle de doenças e promoção de crescimento de plantas economicamente importantes para o estado do Amazonas.
  Período: 2022 - atual / Situação: EM_ANDAMENTO / Natureza: PESQUISA
• Microbiota amazônica como fonte de novos produtos naturais e de soluções sustentáveis para agricultura
  Projeto: Programa FAPEAM Produtividade em CT&I ? Edital n.º 013/2022
  Período: 2023 - atual / Situação: EM_ANDAMENTO / Natureza: OUTRA
• Identificação e obtenção de moléculas com aplicação biotecnológica com base na microbiota amazônica
  EDITAL Nº 004/2018 - AMAZONAS ESTRATÉGICO- O microbioma de guaranazeiro foi estudado durante quatro anos dentro do escopo do projeto: MICROOMA- microbiomas amazônicos: uma abordagem para sustentabilidade e prospecção de bioativos com apoio da CAPES. Com base nos resultados deste projeto foram identificadas novas espécies e selecionados fungos e bactérias com potencial biotecnológico para produção de moléculas bioativas e desenvolvimento de bioprodutos e processos farmacêuticos e agroindustriais. A análise in vitro de metabólitos secundários produzidos por alguns destes micro-organismos revelaram produção de moléculas com atividade antibacteriana, antitumoral e genotóxica. As análises químicas confirmaram a produção de moléculas já conhecidas e que apresentam atividades antifúngicas e antivirais bem como moléculas ainda não descritas. A partir do extrato total, alguns micro-organismos apresentaram atividades antioxidante e/ou antidiabética e algumas espécies de fungos foram capazes de inibir o crescimento de patógenos e a produzir antibióticos e compostos com atividade bacteriostática contra linhagens de bactérias susceptíveis e multirresistentes. Dentre os compostos já conhecidos e encontrados durante a prospecção, estão moléculas associadas ao controle de fitopatógenos e fungos de outras espécies produtores deste tipo de moléculas já são bioformulados e comercializados para o combate a pragas e doenças de plantas. Neste contexto, esta proposta tem como foco a prospecção, identificação, análise do potencial fármaco industrial das moléculas e desenvolvimento de processos para bioformulação visando o controle de doenças causadas por fitopatógenos. Além do aspecto tecnológico, com potencial para obtenção de patentes, a proposta une a produção química de moléculas com uma completa predição, identificação e caracterização de genes e vias metabólicas com potencial para a produção de compostos de interesse biotecnológico como: a trans-AT policetídeo sintase (enzimas que representam um dos principais grupos de proteínas envolvidas na produção de policetídeos bioativos), predição de substrato para sintetases não-ribossomais (NRPS- sintetizam um conjunto diverso de pequenos peptídeos bioativos, muitos dos quais são usados na medicina), predição de terpenos (micotoxinas, antibióticos, compostos antitumorais e fitohormônios), peptídeos produtos de clusters ribossômicamente sintetizados e modificados pós-tradução e mineração computacional genômica para a descoberta de possíveis novas moléculas bioativas.
  Período: 2018 - 2022 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA
• Biodiversidade e prospecção de genes e moléculas de interesse biotecnológico com base na microbiota dos sedimentos de rios amazônicos
  EDITAL UNIVERSAL CNPq 2018 A biodiversidade relacionada a microbiota amazônica tem grande potencial para a identificação novas enzimas, moléculas, prospecção de bioativos e desenvolvimento de novos processos e produtos aplicados às mais diversas cadeias produtivas como agroindústria, indústrias de cosméticos, farmacêutica, alimentícia, ambiental entre outras. Os microrganismos também possuem vantagens na produção de compostos em relação a outras fontes como as plantas, isto se dá em virtude da possibilidade de produção em larga escala, tempo de crescimento reduzido, demandam pouco espaço físico, são mais práticos em termos de edição gênica para ?overexpression? e não sofrem efeitos da sazonalidade para a produção. Contudo, apesar do grande potencial, pouco se conhece sobre a composição da microbiota amazônica e os trabalhos para prospecção de biotivos ainda são pontuais e somente focados em organismos cultiváveis, que representam uma fração mínima da microbiota, se considerarmos que mais de 95% é não cultivável. Neste contexto, esta proposta reúne um grupo multidisciplinar formado por 12 instituições nacionais e uma alemã, como o objetivo de caracterizar a biodiversidade e realizar a prospecção de genes e moléculas de interesse comercial com base na microbiota cultivável e não cultivável dos sedimentos dos rios amazônicos. Esta proposta integra ferramentas químicas e ?ômicas? para o estudo e desenvolvimento de produtos e processos baseados em microrganismos, mesmo aqueles não cultiváveis in vitro, serão aqui explorados por meio da metagenômica funcional via NGS (Next Generation Siquencing) e bibliotecas de expressão. Permitindo deste modo, a identificação de novos genes e vias de biossíntese para compostos com potencial biotecnológico. Além disto, os genomas completos de linhagens produtoras com moléculas bioativas serão obtidos para: 1- transformar estes organismos em verdadeiras biofábricas para a produção de moléculas aplicadas a diversas cadeias produtivas; 2- expressão de clusters crípticos por meio da utilização de DiPac (Direct Pathway Cloning); 3- viabilizar modificações genéticas que vão desde a ?overexpression? de um determinado gene que codifica uma enzima chave em uma via metabólica de interesse e com efetiva aplicação biotecnológica ou 4- ?deleção? de genes relacionados à produção de compostos citotóxicos quando for o caso; 5- desenvolvimento de atividades onde a genômica e sua correlação com a produção de metabólitos secundários são fatores indissociáveis para a agregação de valor, elaboração de novas metodologias e obtenção de patentes.
  Período: 2018 - 2022 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA
• MANUTENÇÃO CORRETIVA E PREVENTIVA DE EQUIPAMENTOS DA CENTRAL MULTIUSUÁRIO DE GENÔMICA E BIOLOGIA MOLECULAR DA EMBRAPA AMAZÔNIA OCIDENTAL
  EDITAL N. 004/2019 - PAMEQ A central multiusuário de Genômica e Biologia Molecular (CMGB) da Embrapa Amazônia Ocidental tem atendido diversas demandas de pesquisa na área relacionadas a ciências ?ômicas? e biologia molecular principalmente em genômica, transcriptômica, proteômica, epigenômica e outras demandas da Embrapa e de diversas instituições do amazonas e outros estados da Amazônia Legal. A central vem promovendo a diversificação e intensificação das pesquisas, principalmente com espécies nativas da Amazônia de importância agroindustrial: açaí, guaranazeiro, caiaué, mandioca/macaxeira, seringueira, cupuaçuzeiro, tambaqui, pirarucu, microrganismos (endofíticos, fitopatogênicos e de solos), assim como espécies que apresentam alto potencial agronômico e biotecnológico para o desenvolvimento da região. Além de apoiar a execução de diversos projetos com as espécies mencionadas, o laboratório atende a estudantes de graduação e de pós-graduação de pelo menos 7 (sete) grupos de pesquisa e 9 (nove) programas de Pós-Graduação: PPG-MBT (UEA), PPG-ATU (INPA), PPG-BIOTEC (UFAM), PPG-CIPET (UFAM), PPG-ECB (UFMT), PPGQ (UFAM), PPGBB (UFMT Rede Pro centro-oeste), PPG-POSAGRO (UFRR) e PPG-Microbiologia Agrícola (UFV). Esta rede de usuários que necessitam usar ferramentas moleculares em alguma etapa de suas pesquisas tem permitido a elaboração de novos projetos multidisciplinares e interinstitucionais que vem propiciando significativos avanços em demandas de pesquisa que são de importância para o Estado do amazonas e para o país. Atualmente a rede de usuários do (CMGB) conta com pesquisadores de 10 (dez) instituições (Embrapa CPAA, Embrapa CEPATU, INPA, UFAM, UEA, UFRR, UFOPA, UFMT, UFT e UFV), atendendo a pelo menos 20 projetos de pesquisa financiados por diferentes órgão de fomento e contribui para a formação de recursos humanos com mais de 30 projetos de estudantes de graduação e pós-graduação que fazem uso direto dos equipamentos da central multiusuário para atingirem seus objetivos. Contudo, para produção de novos ativos de inovação como cultivares/linhagens, estirpe/raça/tipos, coleções biológicas, produtos pré-tecnológicos, entre outros, faz-se necessário a manutenção constante de todos os equipamentos, visando a acuraria e qualidade dos resultados de pesquisa obtidos. Deste modo, esta proposta tem como objetivo realizar manutenção corretiva e preventiva em equipamentos da central multiusuário em Genômica e biologia molecular CPAA visando qualidade, desempenho e precisão das pesquisadas realizadas.
  Período: 2020 - 2022 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA
• Núcleo de pesquisa em genética e ciências 'ômicas' aplicada a agricultura no Amazonas
  EDITAL 007 PRONEM FAPEAM/CNPq- O núcleo de pesquisa em genética e ciências ômicas formado por pesquisadores da Embrapa, ICET/UFAM campus Itacoatiara, UFMT, INPA e UFV propõe soluções inovadoras e sustentáveis para agricultura do estado do amazonas com foco em cultivo do guaranazeiro, utilização da microbiota amazônica e cultivo e reprodução de tambaqui. Este projeto visa consolidar o núcleo de pesquisa em genética e ciências 'ômicas' aplicada a agricultura no Amazonas com foco em viabilizar soluções de pesquisa, inovação e desenvolvimento sustentável para o estado do Amazonas.
  Período: 2018 - 2021 / Situação: DESATIVADO / Natureza: PESQUISA
• Análise funcional de genes candidatos a efetores em Fusarium decemcellulare por meio de CRISPR-CAS9 e sua correlação com alvos expressos em guaranazeiro durante a interação patógeno-hospedeiro
  EDITAL N. 005/2018 - FIXAM Fusarium decemcellulare Brick é o agente causal do superbrotamento no guaranazeiro, uma das principais doenças da cultura que afeta ramos novos e inflorescências desde o estádio de muda até a fase adulta, sendo um dos principais fatores limitantes para essa cultura no norte do país, podendo comprometer em até 100% das plantas. Durante a interação planta-patógeno fungos fitopatógenos secretam pequenas proteínas ricas em cisteínas chamadas de efetores, que manipulam a estrutura e fisiologia da célula hospedeira para permitir a infecção com sucesso, por permitir que o patógeno escape ou desarme os mecanismos de defesa da planta. Uma área recente da genômica funcional, a efetorômica, é uma poderosa ferramenta que tem sido utilizada para identificar genes R (Resistência) em plantas usando efetores como sonda em germoplasma de plantas para reconhecimento específico de proteínas R. Sendo identificado o gene R e validado, este pode ser selecionado nos diferentes genótipos utilizados no melhoramento ou até clonado e inserido no genoma de plantas para tentativas de desenvolvimento de novos cultivares resistentes ao patógeno. Neste contexto, o presente projeto tem como objetivo analisar o papel funcional dos genes candidatos a efetores por meio da edição de genoma via CRISPR-CAS9 em Fusarium decemcellulare e analisar a interação de proteínas candidatas a efetoras-proteína vegetal in planta. A seleção de genes candidatos a efetores será feita inicialmente com a predição do secretoma por meio de sequências preditas de proteínas no genoma sequenciado de F. decemcellulare. Para análise de expressão de genes de proteínas secretadas que podem ser requeridos para o desenvolvimento dos sintomas no superbrotamento em órgãos reprodutivos e vegetativos do guaranazeiro, serão usados transcriptomas de F. decemcellulare já sequenciados. A análise funcional dos efetores será realizada utilizado o sistema CRISPR-CAS9 para linhagens knockout de F. decemcellulare usado o vetor FDC-CRISPR-CAS9 contendo RNA guia sob o controle do promotor da RNA polIII de F. decemcellulare. A análise sublocalização celular vegetal dos candidatos a efetores será feito por meio de agroinfiltração com proteínas de interesse marcada com proteína verde fluorescente (GFP). Serão também realizadas determinações de interações proteínas candidatas efetora-proteína alvo vegetal por meio de co-imunopreciptação. A análise funcional dos genes candidatos a efetores, em F. decemcellulare contribuirá para o melhor entendimento da biologia deste patógeno, bem como sua interação com o guaranazeiro, além de fornecer dados que podem ser utilizados no melhoramento genético do guaranazeiro, bem como no controle da doença. Além destas contribuições a validação do sistema de edição de genoma CRISPR-CAS9 será uma valiosa contribuição ao para estudos de genômica funcional neste patógeno que atinge mais de 80 diferentes hospedeiros em regiões tropicais e subtropicais. BOLSISTA PÓS-DOC FIXAM: Casley Borges Queiroz
  Período: 2019 - 2020 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA
• Identificação e análise de moléculas e vias metabólicas com potencial biotecnológico em duas novas espécies de Arcopilus isoladas de guaranazeiro
  EDITAL Nº 002/2018 - FAPEAM UNIVERSAL AMAZONAS Duas novas espécies de fungo do gênero Arcopilus endofíticas de guaranazeiro foram identificadas por nosso grupo de pesquisa durante a execução do projeto apoiado pela CAPES- ?MICROOMA- microbiomas amazônicos: uma abordagem para sustentabilidade e prospecção de bioativos?. Análise previa de metabólitos secundários com atividade biológica confirmaram a produção de moléculas já conhecidas com atividades antifúngicas, antivirais e antitumorais e outras potencialmente ainda não descritas. Além disso, análise química dos metabólitos secundários secretados por estes fungos, a partir do extrato total, apresentam atividade antioxidante e antidiabética. Dentre os compostos já conhecidos encontrados durante a prospecção, estão moléculas associadas ao controle de fitopatógenos e fungos de outras espécies produtores deste tipo de moléculas já são bioformulados e comercializados para o combate a pragas e doenças de plantas. Tendo em vista o fato de estarmos trabalhando com duas novas espécies, o que aumenta possibilidade de descoberta de compostos ainda não descritos, esta proposta tem como foco a identificação de moléculas e uma análise detalhada do potencial fármaco industrial e desenvolvimento de processos para bioformulação visando o controle de doenças fúngicas em guaranazeiro. Além do aspecto tecnológico, com potencial para obtenção de patentes, a proposta une a produção química de moléculas com uma completa predição, identificação e caracterização de genes e vias metabólicas com potencial para a produção de compostos de interesse biotecnológico como: a trans-AT policetídeo sintase (enzimas que representam um dos principais grupos de proteínas envolvidas na produção de policetídeos bioativos), predição de substrato para sintetase não-ribossomais (NRPS- sintetizam um conjunto diverso de pequenos peptídeos bioativos, muitos dos quais são usados na medicina), predição de terpenos (micotoxinas, antibióticos, compostos antitumorais e fitohormônios) e peptídeos produtos de clusters ribossômicamente sintetizados e modificados pós-tradução. Bem como, mineração computacional genômica para a descoberta de possíveis novas moléculas bioativas. As análises genômicas são a base para a futura obtenção de linhagens transformantes (editadas geneticamente) para que funcionem como verdadeiras biofábricas voltadas à produção de moléculas de acordo com o interesse do mercado.
  Período: 2018 - 2019 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA
• MANUTENÇÃO CORRETIVA E/OU PREVENTIVA DE EQUIPAMENTOS DA INFRAESTRUTURA DA CENTRAL MULTIUSUÁRIO EM BIOLOGIA MOLECULAR DA EMBRAPA AMAZONIA OCIDENTAL VISANDO O DESENVOLVIMENTO DE PROCESSOS E PRODUTOS COM QUALIDADE E ACURÁCIA
  O laboratório multiusuário de Biologia Molecular (LBM) da Embrapa Amazônia Ocidental tem atendido diversas demandas de pesquisa na área relacionadas a ciências ?ômicas? principalmente em genômica e transcriptômica e vem promovendo a diversificação e intensificação das pesquisas, principalmente com espécies nativas, como o guaranazeiro, caiaué, mandioca/macaxeira, seringueira, cupuaçuzeiro, microrganismos (endofíticos, fitopatogênicos e de solos) e com peixes, culturas/espécies que apresentam alto potencial agronômico e biotecnológico para o desenvolvimento da região. Novas propostas têm sido discutidas pelas equipes usuárias do LBM, incluindo pesquisadores das diferentes Unidades da Embrapa na região e também de instituições parceiras. As equipes tem buscado atender as novas demandas de pesquisa que são de importância para o Estado do amazonas e para o pais. Várias propostas foram submetidas e aprovadas em portfólios/arranjos e também aprovadas em fontes externas (FAPEAM, CNPq, CAPES). Dentro deste contexto, atualmente 23 projetos de pesquisa fazem uso direto dos equipamentos do LBM para atingirem seus objetivos, dos quais a maior parte está associada a portfólios/arranjos já estabelecidos, cita-se: Portfólio da Palma de Óleo (seis projetos), Portfólio de Aquicultura (dois projetos e um Plano de Ação), Portfólio de Monitoramento da Dinâmica do Uso e Cobertura da Terra (dois projetos), Portfólio de Recursos Florestais Nativos (um projeto - Seringueira) e Arranjo de Bioativos (um projeto). Além dos projetos financiados por diferentes fontes, o laboratório atende pesquisadores associados a pelo menos 5 diferentes cursos de pós-graduação e atua fortemente na formação de recursos humanos, possuindo no momento pelo menos 20 estudantes nos diversos níveis. Contudo, para produção de novos ativos de inovação como cultivares/linhagens, estirpe/raça/tipos, coleções biológicas, produtos pré-tecnológicos, entre outros, faz-se necessário a manutenção constante de todos os equipamentos, visando a acuraria e qualidade dos resultados de pesquisa obtidos. Deste modo, esta proposta tem como objetivo realizar manutenção corretiva e preventiva em equipamentos multiusuário de biologia molecular do CPAA visando qualidade, desempenho e precisão das pesquisadas realizadas.
  Período: 2015 - 2019 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA
• Genômica e Biotecnologia Aplicada a Agricultura e desenvolvimento tecnológico da Amazônia
  CHAMADA PÚBLICA MCTIC/FINEP/FNDCT/AT - AMAZÔNIA LEGAL - 04/2016 Em geral, a infraestrutura das instituições de pesquisa na região norte e Amazônia legal é insuficiente, precária ou inadequada à pesquisa e reduzem o potencial das cadeias produtivas vinculadas aos recursos naturais, ao patrimônio genético e à biodiversidade regional, reduzindo as possibilidades da bioprospecção e da biotecnologia bem como da geração de valor associados a estas cadeias. Este potencial poderia ser melhor explorado com a melhoria e ampliação da infraestrutura de pesquisa. Visando superar os gargalos tecnológicos, este projeto visa intensificar esforços para o desenvolvimento de pesquisas de alta qualidade com base na biodiversidade da Amazônia legal por meio da adequação da infraestrutura de pesquisa do laboratório multiusuário em biotecnologia e biologia molecular aplicada a agricultura que atende as demandas de pesquisa e desenvolvimento tecnológico de baixa e alta complexidade.
  Período: 2018 - 2019 / Situação: DESATIVADO / Natureza: PESQUISA
• MICROOMA- microbiomas amazônicos: uma abordagem para sustentabilidade e prospecção de bioativos
  O projeto ?Microoma ? Microbiomas amazônicos: uma abordagem para sustentabilidade e prospecção de bioativos? ? está pautado na caracterização do microbioma de duas espécies nativas da região amazônica, o guaranazeiro (Paullinia cupana var. sorbilis) e a seringueira (Hevea brasiliensis), que são importantes do ponto de vista econômico. A proposta, aprovada pela Capes (Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior), é composta pela Embrapa Amazônia Ocidental, Universidade Federal do Amazonas, Universidade Federal do Mato Grosso e Universidade Federal de Viçosa. Dentro deste contexto, o projeto está focado no microbioma do guaranazeiro, tendo como foco a detecção de microrganismos não cultiváveis por meio de metagenoma, objetivando a identificação das espécies e função de genes que poderão ser explorados visando o incremento na produção de guaraná, assim como microrganismos não cultiváveis como potenciais agentes de controle biológico, indutores de resistência contra fitopatógenos ou insetos-praga e/ou promotores de crescimento de plantas. A construção de uma base de dados genômicos estratégicos ? ?genotecas? ? dos microrganismos poderá ser ainda amplamente explorada para diferentes propósitos, desde as aplicações agronômicas acima mencionadas, até em questões de farmacologia. Os microrganismos cultiváveis isolados serão identificados e também serão analisados quanto à produção de compostos com atividade antimicrobiana e a produção de enzimas de interesse biotecnológico. Será realizada a obtenção dos extratos orgânicos, a separação e a identificação dos compostos antimicrobianos utilizando técnicas apropriadas para cada processo. Os compostos isolados poderão ser usados no controle de fitopatógenos, tanto fungos quanto bactérias. Além disso, o projeto ainda tem como objetivo realizar a caracterização molecular do agente causal do superbrotamento em guaranazeiro, um patógeno que vem causando perdas significativas à cultura e pouco se conhece sobre o ponto de vista epidemiológico e da interação planta-patógeno.
  Período: 2014 - 2018 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA
• Fusarium decemcellulare DA GENÉTICA AO METABOLOMA NA BUSCA DE SOLUÇÕES PARA O CONTROLE DO SUPERBROTAMENTO EM GUARANAZEIRO (Paullinia cupana var. sorbilis)
  Fusarium decemcellulare (teleomorfo Albonectria rigidiuscula) é o agente causal de diferentes fitopatologias com sintomas variados em mais de cinquenta plantas tropicais e subtropicais. Em guaranazeiro o complexo superbrotamento causado por F. decemcellulare é caracterizado pela hiperplasia floral, galhas no caule e superbrotamento das gemas vegetativas; nos últimos anos tem se tornado uma das doenças mais importantes da cultura, provocando perdas de até 100% da produção. O problema torna-se mais grave devido ao fato que o inseto vetor Liothrips adisi, principal praga da cultura do guaraná além de causar sérios danos, ainda atua na disseminação do patógeno. Pouco se conhece sobre a interação planta- patógeno e fatores de patogenicidade ou virulência utilizados por F. decemcellulare no processo de infecção. Trabalhos básicos como estudo da variabilidade, diversidade e estrutura da população, que auxiliam diretamente o melhoramento genético e predição do potencial evolutivo do patógeno, ainda não foram realizados. Esta proposta visa explorar aspectos da biologia de F. decemcellulare e tem como objetivos realizar as caracterizações: 1- genética por meio da análise do transcriptoma e da variabilidade, diversidade, estrutura da população do patógeno; 2- histopatológica mediante a análise do processo de penetração, infecção e colonização com o auxílio das proteínas verde e vermelha fluorescentes (GFP e RFP) e microscopia eletrônica; e 3- dos produtos do metabolismo secundário do patógeno em culturas axênicas e durante a infecção visando a identificação de metabólicos possivelmente relacionados ao desenvolvimento da doença e com potencial para aplicações biotecnológicas. Os resultados obtidos contribuirão direta e indiretamente para o programa de melhoramento do guaranazeiro e na busca de soluções para o controle da doença por meio do melhoramento genético quanto por estratégias biotecnológicas.
  Período: 2015 - 2017 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA
• ESTUDO MORFO-MOLECULAR DOS SINTOMAS DE SUPERBROTAMENTO EM GUARANAZEIRO E CARACTERIZAÇÃO GENÉTICA DO AGENTE CAUSAL Fusarium decemcellulare
  O principal objetivo do projeto aqui descrito é estudar a interação entre o guaranazeiro (Paullinia cupana var. sorbilis) e o fungo Fusarium decemcellulare, agente causal do superbrotamento. O superbrotamento é uma das principais doenças do guaranazeiro no Amazonas, segundo Estado produtor de guaraná no país e quiçá no mundo, uma vez que produção comercial de guaraná ocorre apenas no Brasil. Há cultivares desenvolvidas pela Embrapa que são resistentes e outras acometidos em escalas diferentes pela doença, mas plantas com grau de acometimento muito grave ocorrem e precisam ser eliminadas dos plantios. Serão utilizadas a microscopia e a quantificação de expressão gênica para analisar a morfologia dos sintomas, a fisiologia e a biologia molecular da interação e do desenvolvimento dos sintomas da doença e marcadores moleculares para análise de diversidade de F. decemcellulare em cinco localidades do Estado do Amazonas. A associação de todos os resultados obtidos vai contribuir para a compreensão da doença e do agente causal, bem como para a criação de tecnologias de controle.
  Período: 2015 - 2017 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA
• Biologia molecular e genética de fungos fitopatogêncios
  FAPEAM -Edital ? EDITAL N. 020/2013 - PAPAC
  Período: 2014 - 2016 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA
• Genômica funcional de fungos fitopatogênicos de importância para a Amazônia
  Os fitopatógenos Mycosphaerella fijiensis (agente causal da sigatoka-negra), Fusarium. oxysporum f. sp. cubense (agente causal do mal-do-Panamá) e Fusarium solani f. sp. piperis (agente causal da fusariose em pimenta-do-reino) causam importantes perdas que limitam a bananicultura e pipericultura na Amazônia. Das doenças que atingem Musa ssp. destaca-se a sigatoka-negra, em virtude da severidade da doença em genótipos comercialmente importantes, necessidade de se realizar grande número de aplicações de fungicidas para controle da doença e de haver poucas cultivares resistentes. Todavia, o mal-do-Panamá é também reconhecido como uma das doenças mais destrutivas da bananeira no mundo, ao contrário da sigatoka-negra, o mal-do-Panamá é endêmico em todas as regiões do mundo. Seu controle com fungicidas é inviável e o uso de cultivares resistentes está condicionado à aparição de novas raças do patógeno. A fusariose em pimenta-do-reino (Piper nigrum L.) causa podridão das raízes e secamento dos ramos, ocasionando a morte rápida das plantas e redução da produção em cerca de 10%, com prejuízos em torno de cinco milhões de dólares por ano. Dada a importância destes patógenos para o agronegócio, alguns avanços na identificação de genes têm sido obtidos. No entanto, além dos dados serem ainda restritos, há carência de informações sobre a função de genes identificados com provável associação com a patogenicidade, virulência, proteínas efetoras ou mesmo fatores de compatibilidade. A partir da identificação de quais genes são importantes para causar a doença, é possível buscar formas de controle que vão desde o melhoramento clássico ao uso de métodos como o silenciamento trans-específico que já tem sido aplicado no controle de fitopatógenos. O Silenciamento de genes do patógeno no processo de interação com planta é apenas umas das inúmeras possibilidades no controle das doenças a partir do conhecimento de quais genes ou até mesmo rotas metabólicas podem ser atacados com efetiva perda da patogenicidade. O presente trabalho tem como objetivo identificar o papel funcional de genes envolvidos nos mecanismos de patogenicidade e/ou virulência por meio da obtenção de mutantes via recombinação homóloga e RNA de interferência.
  Período: 2013 - 2015 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA
• Análise funcional de genes relacionados a patogenicidade via Knock-out e Knock-down em Mycosphaerella fijiensis , Fusarium oxysporum f. sp. cubense e Fusarium solani f. sp. piperes
  Período: 2011 - 2013 / Situação: EM_ANDAMENTO / Natureza: PESQUISA
• Identificação de fatores de patogenicidade em Mycosphaerella fijiensis e Fusarium oxysporum f. sp. cubense.
  Os fitopatógenos Mycosphaerella fijiensis Morelet e Fusarium oxysporum f, sp, cubense são os agentes causais da sigatoka-negra e do mal-do-panamá em bananeira respectivamente. Esses patógenos são considerados de os de maior importância na maioria das regiões produtoras de bananas do mundo. O ataque resulta na produção de frutos pouco desenvolvidos e impróprios à comercialização ou pode até causar a morte das plantas em virtude da redução da capacidade fotossintética ou mucha pela obstrução do sistema vascular da planta. Os mecanismos de patogenicidade e virulência para ambos os patógenos não são bem conhecidos e estudos visando a obtenção de mutantes não patogênicos por meio da identificação de genes relacionados a patogenicidade ajudará na elucidação de passos importantes na colonização do tecido hospedeiro, identificando pontos chave no processo da doença e permitindo o desenvolvimento de ferramenta de controle. Nossa proposta visa ainda estudar genes candidatos a fator de patogenicidade em por meio de mutagenese sítio direcionada.
  Período: 2010 - 2012 / Situação: EM_ANDAMENTO / Natureza: PESQUISA
• Obtenção de mutantes deficientes na patogenicidade e regulação por pH em Mycosphaerella fijiensis agente causal da sigatoka-negra
  O fitopatógeno Mycosphaerella fijiensis Morelet agente causal da sigatoka-negra em bananeira é considerado o patógeno de maior importância na maioria das regiões produtoras de bananas do mundo. O ataque resulta na produção de frutos pouco desenvolvidos e impróprios à comercialização ou pode até causar a morte das plantas em virtude da redução da capacidade fotossintética. Os mecanismos de patogenicidade e virulência de M. fijiensis não são bem conhecidos e estudos visando a obtenção de mutantes não patogênicos ajudará na elucidação de passos importantes na colonização do tecido hospedeiro, além de propiciar a obtenção de linhagens úteis em experimentos de genética clássica, transformação e manipulação molecular. Nossa proposta visa ainda estudar as condições de pH que é um importante componente fisiológico relacionado à patogenicidade em muitos fungos, além de ser um ponto para o desenvolvimento de formas de controle em plantas cultivadas.
  Período: 2008 - 2011 / Situação: EM_ANDAMENTO / Natureza: PESQUISA
• Caracterização de Isolados de Mycosphaerella fijiensis
  Período: 2008 - 2010 / Situação: EM_ANDAMENTO / Natureza: PESQUISA
• Sigatoka-negra: análise da virulência e caracterização da estrutura genética da população de Mycosphaerella fijiensis por meio de Retrotransposons e VNTR.
  O fitopatógeno Mycosphaerella fijiensis Morelet agente causal da sigatoka-negra em bananeira é considerado o patógeno de maior importância na maioria das regiões produtoras de bananas do mundo. O ataque resulta na produção de frutos pouco desenvolvidos e impróprios à comercialização ou pode até causar a morte das plantas em virtude da redução da capacidade fotossintética. Em virtude da ausência de dados sobre a virulência e diversidade genética da população de M. fijiensis do Brasil, se faz necessário a obtenção de marcadores que possibilitem a análise da diversidade e detecção do patógeno, auxiliando dessa forma: no estudo da estrutura genética, na determinação do fluxo gênico, no rastreamento e diagnostico molecular das zonas livres. Desse modo a presente proposta visa avaliar a virulência de isolados M. fijiensis obtidos de diferentes regiões do Brasil, analisar a regulação dos genes que codificam proteínas relacionadas a transposição de retrotransposons, sob diferentes condições de estresse usando a técnica de PCR em tempo real e estudar a estrutura genética populacional do fungo usando os marcadores IRAP, REMAP e S-SAP e VNTR
  Período: 2008 - 2010 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA
• Análise da diversidade de Mycosphaerella fijiensis do Brasil
  A banana constitui parte importante da alimentação e renda dos pequenos produtores rurais. No entrando, vários fatores são limitantes da produção, como manejo inadequado e o ataque de doenças, dentre as quais podemos destacar a sigatoka-negra causada pelo fungo Mycosphaerella fijiensis Morelet que ataca a bananeira, tem sido considerada a doença mais importante na maioria das regiões produtoras do mundo. O ataque resulta na produção de frutos pouco desenvolvidos e impróprios à comercialização ou pode até causar a morte das plantas em virtude da redução da capacidade fotossintética. O estudo da diversidade, juntamente com a busca de estratégias para o controle da doença, principalmente por meio de melhoramento visando resistência é a forma mais econômica e ambientalmente correta. Análise molecular da diversidade é crucial para guiar as estratégias de melhoramento e até mesmo no manejo. Desde modo, este trabalho tem por objetivo estudar a diversidade de M. fijiensis por meio de marcadores SSR contribuindo para otimização do manejo de genes de resistência e durabilidade dos métodos de controle empregado no cultivo de banana, que de grande importância no Estado do Amazonas.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
  Período: 2007 - 2009 / Situação: EM_ANDAMENTO / Natureza: PESQUISA
• Isolamento e caracterização dos genes que codificam poligalacturonases em Crinipellis perniciosa
  Período: 2005 - 2007 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA

• CIENCIAS_BIOLOGICAS :: Biotecnologia :: Biotecnologia ::
• CIENCIAS_BIOLOGICAS :: Genética :: ::
• CIENCIAS_BIOLOGICAS :: Genética :: Genética Molecular e de Microorganismos ::
• CIENCIAS_BIOLOGICAS :: Microbiologia :: Biologia Molecular ::
• CIENCIAS_BIOLOGICAS :: Microbiologia :: Genômica aplicada ::

• Espanhol: Lê: BEM, Fala: POUCO, Escreve: POUCO, Compreende: BEM
• Inglês: Lê: BEM, Fala: BEM, Escreve: RAZOAVELMENTE, Compreende: BEM

Tipo de Produção	<	2020	2021	2022	2023	Total
Banca Julgadora para Concurso Público	1	0	0	0	0	1
Participação em Banca de Doutorado	3	1	3	1	1	9
Participação em Banca de Exame de Qualificação	5	0	1	0	0	6
Participação em Banca de Graduação	1	0	0	0	0	1
Participação em Banca de Mestrado	1	1	2	1	0	5
Total	11	2	6	2	1	22

Tipo de Produção	<	2023	Total
Participação em Congresso	3	0	3
Participação em Encontro	5	0	5
Participação em Seminário	1	0	1
Participação em Simpósio	4	1	5
Total	13	1	14

Tipo de Produção	<	2020	2021	2022	2023	2024	Total
Orientação em Andamento de Doutorado	0	1	4	1	4	0	10
Orientação em Andamento de Iniciação Científica	0	0	0	0	2	0	2
Orientação em Andamento de Mestrado	0	1	1	0	3	3	8
Orientações Concluídas para Doutorado	7	0	0	0	0	0	7
Orientações Concluídas para Mestrado	11	4	2	0	0	0	17
Orientações Concluídas para Pós-Doutorado	6	3	1	0	0	0	10
Outras Orientações Concluídas	60	6	6	8	4	0	84
Total	84	15	14	9	13	3	138

Tipo de Produção	<	2020	2021	2022	2023	2024	Total
Apresentação de Trabalho	5	1	0	0	1	0	7
Artigo Aceito para Publicação	0	0	0	0	0	1	1
Artigo Publicado	36	11	6	3	10	9	75
Capitulo de Livro Publicado	10	0	0	0	0	0	10
Curso de Curta Duração Ministrado	1	1	0	0	0	0	2
Organização de Evento	0	0	0	0	1	0	1
Outras Orientações em Andamento	0	0	0	1	0	0	1
Outras Participações em Eventos e Congressos	1	0	0	0	0	0	1
Outras Produções Bibliográfica	1	0	0	0	0	0	1
Programa de Rádio ou TV	0	7	0	0	0	0	7
Trabalho em Eventos	106	0	0	18	51	0	175
Total	160	20	6	22	63	10	281

Tipo de Produção	2020	Total
Processos e Técnicas	1	1
Total	1	1