Título | PLANEJAMENTO in silico DE NOVOS INIBIDORES COM POTENCIAL ATIVIDADE INSETICIDA CONTRA Aedes aegypti A PARTIR DA PIPERINA EXTRAÍDA DO Piper nigrum LINN |
Data da Defesa | 20/12/2019 |
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Banca
Examinador | Instituição | Aprovado | Tipo |
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Dr. Agnaldo da Silva Carneiro | Universidade Federal do Pará | Sim | Membro | Dr. Antônio Maia de Jesus Chaves Neto | Universidade Federal do Pará | Sim | Membro | Dr. Cleydson Breno Rodrigues dos Santos | UNIFAP | Sim | Membro | Dr. Osmar Alves Lameira | EMBRAPA | Sim | Membro | Dr. Rosivaldo dos Santos Borges | Universidade Federal do Pará | Sim | Presidente |
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Palavras-Chaves | Piper nigrum Linn, Modelagem Molecular, Triagem Virtual. |
Resumo | O Aedes aegypti é o principal vetor de transmissão da dengue, febre amarela, zika e
chikungunya em regiões tropicais e subtropicais e é considerado causador de riscos à
saúde de milhões de pessoas no mundo. A piperina, encontrada na espécie Piper nigrum
Linn apresenta uma variedade de atividades biológicas, dentre as quais, atividade
larvicida contra o Ae. aegypti. Neste estudo, foi realizada um estudo computacional da
piperina por meio de análise conformacional e avaliação da influência do anel
piperidínico na estabilidade e reatividade química. Também buscamos obter novas
moléculas com potencial inseticida contra Ae. aegypti via triagem virtual a partir da
piperina. Os resultados do estudo computacional mostraram que os confôrmeros 1 e 3 da
piperina exibiram maior estabilidade conformacional e menor barreira de energia para o
sistema butadieno. As conformações com o anel benzeno no plano (1, 3, 5 e 7)
apresentaram menor estabilidade que as conformações com anel benzeno fora do plano
(2, 4, 6 e 8). As barreiras de energia de todos os confôrmeros do ácido pipérico foram
mais baixas quando comparadas a piperina, e todos os 1,3-butadieno s-trans foram mais
estáveis que todos os 1,3-butadieno s-cis. Em relação as propriedades eletrônicas, o ácido
pipérico mostrou maior eletrofilicidade quando comparado a piperina, e esta apresentouse mais nucleofílica em relação ao ácido pipérico. O ácido pipérico mostrou-se mais
reativo que a piperina. Em resumo, estabilidade química da piperina está relacionada ao
anel piperidínico através de propriedades estéricas e eletrônicas. Em relação a triagem
virtual, I40, JHIII, piriproxifeno e o temefós foram escolhidos como compostos controle
para pesquisa de moléculas no banco de dados Zinc_Natural_Stock (ZNSt) e MolPort.
Após a triagem virtual das 626 estruturas obtidas dos bancos de dados, oito compostos
resultantes do docking molecular foram submetidos a predição de atividade inseticida
pelo servidor PASS e de propriedades farmacocinéticas e toxicológicas pelos softwares
PreADMET e ProTox-II. As moléculas NESBio_01 e NESBio_02 apresentaram
previsões satisfatórias e tiveram suas propriedades toxicológicas determinadas pelas
plataformas ProTox-II e DEREK. Após análise, o composto NESBio_01 apresentou
melhor perfil para atividade inseticida por atuar na esterase da acetilcolina, com o maior
resultado de afinidade de ligação (-13,14 kcal/mol), superior a afinidade de ligação dos
controles I40 (-13,10 kcal/mol), piriproxifeno (-9,70 kcal/mol) e temefós (-4,80 kcal/mol)
para a enzima acetilcolinesterase do inseto Drosophila melanogaster, mosca da fruta
(PDB ID 1QON, I40). Além disso, o composto NESBio_01 demonstrou propriedades
farmacocinéticas e toxicológicas satisfatórias e melhor quando comparado ao composto
NESBio_02 para a saúde humana no estudo in silico. Nesse sentido, NESBio_01
mostrou-se promissor em todas as etapas do estudo e pode ser considerada a molécula
eleita resultante da triagem virtual como agente inseticida. |
Abstract | Aedes aegypti is the main vector of transmission of dengue, yellow fever, zika and
chikungunya in tropical and subtropical regions and it is considered to cause health risks
to millions of people worldwide. Piperine, found in the species Piper nigrum Linn,
presents a variety of biological activities, among which, larvicidal activity against Ae.
aegypti. In this study, a computational study of piperine was performed through
conformational analysis and evaluation of the influence of the piperidine ring on chemical
stability and reactivity. We also seek to obtain new molecules with potential insecticide
against Ae. aegypti via virtual screening from piperine. The results of the computational
study showed that piperine conformers 1 and 3 exhibited greater conformational stability
and lower energy barrier for the butadiene system. Conformations with the benzene ring
on plane (1, 3, 5 and 7) showed less stability than the conformations with the benzene
ring out plane (2, 4, 6 and 8). The energy barriers of all piperic acid conformers were
lower when compared to piperine, and all 1,3-butadiene s-trans were more stable than all
1,3-butadiene s-cis. Regarding electronic properties, piperic acid showed greater
electrophilicity when compared to piperine, and this one was more nucleophilic in
comparation to piperic acid. Piperic acid was more reactive than piperine. In summary,
chemical stability of piperine is related to the piperidine ring through steric and electronic
properties. In relation to virtual screening, I40, JHIII, pyriproxifene and temephos were
chosen as control compounds for searching for molecules in the database
Zinc_Natural_Stock (ZNSt) and MolPort. After the virtual screening of the 626 structures
obtained from the databases, eight compounds resulting from molecular docking were
subjected to prediction of insecticidal activity by the PASS server and pharmacokinetic
and toxicological properties by PreADMET and ProTox-II softwares. The molecules
NESBio_01 and NESBio_02 presented satisfactory predictions and had their
toxicological properties determined by ProTox-II and DEREK platforms. After analysis,
the compound NESBio_01 showed a better profile for insecticidal activity because it acts
on acetylcholine esterase, with the highest binding affinity result (-13.14 kcal/mol),
superior to the binding affinity of the I40 (-13.10 kcal/mol), pyriproxifene (-9.70 kcal /
mol) and temephos (-4.80 kcal / mol) controls for the enzyme acetylcholinesterase of the
insect Drosophila melanogaster, fruit fly (PDB ID 1QON, I40). In addition, the
compound NESBio_01 demonstrated satisfactory pharmacokinetic and toxicological
properties and better when compared to the compound NESBio_02 for human health in
the in silico study. In this sense, NESBio_01 proved to be promising in all stages of the
study and can be considered the chosen molecule resulting from virtual screening as an
insecticidal agent. |