Corpo Discente - Egressos
Aline Vidor Melao Duarte
| Título | Ocorrência da Mancha de Ramulispora em Mato Grosso e Variabilidade Genética de Ramulispora Sorghi. | ||||||||||||||||||||||||
| Data da Defesa | 09/08/2019 | ||||||||||||||||||||||||
| Download | Em sigilo | ||||||||||||||||||||||||
Banca
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| Palavras-Chaves | Patógeno; doença foliar; marcador molecular; ISSR. | ||||||||||||||||||||||||
| Resumo | Várias doenças podem interferir no desenvolvimento e produtividade do sorgo (Sorghum bicolor (L.) Moench). Entre elas, destaca-se a mancha de Ramulispora sorghi que ocasiona diversos prejuízos à cultura, causando lesões foliares necróticas e reduzindo a área fotossintética da planta. Apesar de sua presença na maioria das áreas cultiváveis de sorgo, no Estado de Mato Grosso não havia relatos anteriores de sua ocorrência, assim, este trabalho foi dividido em capítulos que irão abordar o relato da ocorrência de Ramulispora sorghi nos plantios de sorgo em Cáceres-MT e, a variabilidade genética dos isolados coletados. Para confirmar a ocorrência da doença, fragmentos de folhas com sintomas da doença foram coletados, desinfetados e transferidos para placas de Petri contendo meio ágar-água, com posterior incubação a 27º C, com fotoperíodo de 12 horas, por sete dias, para o isolamento do fungo e a obtenção da cultura monospórica. Após o crescimento micelial, o fungo foi transferido para placas com meio de farinha de aveia e, após sete dias, realizou-se o cultivo monospórico. As culturas monospóricas foram depositadas na micoteca do Laboratório de Recursos Genéticos & Biotecnologia da UNEMAT utilizando-se quatro métodos de preservação: a seco em microtubos, em meio Castellani, em papel filtro e em tubos de ensaio. Plantas de sorgo com 28 dias foram inoculadas com isolados, em casa de vegetação, e observadas os sintomas característicos da mancha de ramulispora, sendo realizado o reisolamento do fungo presente nas lesões e, confirmando as estruturas de R. sorghi em laboratório, com o auxílio de um microscópio estereoscópio e microscópio óptico, completando-se o Postulado de Koch. O segundo capítulo aborda a variabilidade genética dos isolados, para tal, foi feita a extração do DNA genômico de 40 isolados e as análises genéticas foram feitas com marcador molecular do tipo ISSR. Os dados foram avaliados quanto ao conteúdo de informação polimórfica (PIC) e a estrutura genética da população. Posteriormente a matriz de dados foi gerada utilizando-se o Coeficiente de Nei e Li e a partir deste coeficiente de similaridade os métodos de UPGMA e Tocher foram aplicados. Os resultados obtidos para o PIC variaram de 0,33 ((GTG)6 e AP1) a 0,21 (AP4), com média de 0,27, demonstrando que os primers foram considerados medianamente informativos e a estrutura genética da população apresentou o melhor valor de k=2, com a presença de alguns introgressores. O UPGMA resultou na formação de um dendrograma com a presença de quatro grupos distintos e o coeficiente de correlação cofenética apresentou valor de r= 0,84, evidenciando consistência entre os agrupamentos obtidos. O método de otimização de Tocher alocou os isolados em 10 grupos distintos, apresentando semelhança com o UPGMA. Diante disso os resultados aqui apresentados possibilitam identificar a ocorrência de Ramulispora sorghi nos plantios realizados em Cáceres e a existência de variabilidade genética entre os 40 isolados. | ||||||||||||||||||||||||
| Abstract | Several diseases can interfere with the development and productivity of sorghum (Sorghum bicolor (L.) Moench). Among them, there is the spot of Ramulispora sorghi that causes several damages to the crop, causing necrotic leaf lesions and reducing the photosynthetic area of the plant. Despite its presence in most sorghum cultivable areas, in the State of Mato Grosso there were no previous reports of its occurrence, so this work was divided into chapters that will address the report of the occurrence of Ramulispora sorghi in sorghum plantations in Cáceres- MT e, the genetic variability of the isolates collected. To confirm the occurrence of the disease, leaf fragments with symptoms of the disease were collected, disinfected and transferred to petri dishes containing agar-water medium, with subsequent incubation at 27º C, with a 12-hour photoperiod for seven days for isolation. Fungus and the obtainment of monosporic culture. After mycelial growth, the fungus was transferred to plates with oatmeal medium and, after seven days, monosporic cultivation was performed. The monosporic cultures were deposited in the UNEMAT Genetic Resources & Biotechnology Laboratory Mycoteca using four preservation methods: microtube dry, Castellani medium, filter paper and test tubes. Sorghum plants at 28 days old were inoculated with isolates in a greenhouse and the characteristic symptoms of ramulispora leaf spot were observed. The fungus was re-isolated from the lesions, confirming the structures of R. sorghi in the laboratory, with the aid of a stereoscope microscope and optical microscope, completing the Koch Postulate. The second chapter deals with the genetic variability of the isolates. To this end, the genomic DNA was extracted from 40 isolates and the genetic analyzes were made with an ISSR molecular marker. Data were evaluated for polymorphic information content (PIC) and population genetic structure. Subsequently the data matrix was generated using the Nei and Li coefficient and from this similarity coefficient the UPGMA and Tocher methods were applied. The results obtained for the PIC ranged from 0.33 ((GTG)6 and AP1) to 0.21 (AP4), with an average of 0.27, demonstrating that the primers were considered to be moderately informative and the genetic structure of the population presented the same. best value of k = 2, with some introgressors present. The UPGMA resulted in the formation of a dendrogram with the presence of four distinct groups and the cofenetic correlation coefficient presented a value of r = 0.84, showing consistency between the obtained groupings. Tocher`s optimization method allocated the isolates in 10 distinct groups, showing similarity with UPGMA. Therefore, the results presented here make it possible to identify the occurrence of Ramulispora sorghi in plantations carried out in Cáceres and the existence of genetic variability among the 40 isolates. | ||||||||||||||||||||||||
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