Corpo Discente - Egressos
Bruno Wagner Zago
| Título | DIVERSIDADE GENÉTICA DE ACESSOS DE MANDIOCA DA MESORREGIÃO CENTRO-SUL DO ESTADO DE MATO GROSSO | ||||||||||||||||||||||||
| Data da Defesa | 29/06/2018 | ||||||||||||||||||||||||
| Download | Em sigilo | ||||||||||||||||||||||||
Banca
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| Palavras-Chaves | Manihot esculenta CRANTZ, Estatística multivariada, Divergência morfoagronômica e molecular | ||||||||||||||||||||||||
| Resumo | A mandioca (Manihot esculenta Crantz) é uma cultura importante em países em desenvolvimento, principalmente em função da sua rusticidade e capacidade de produzir bem em condições em que outras culturas não sobreviveriam. Tal habilidade advém da tolerância natural da espécie a solos ácidos e à seca. O cultivo da mandioca no Estado do Mato Grosso está baseado na agricultura familiar, constituindo-se fonte de renda agrícola para muitos assentamentos rurais. A variabilidade genética para a cultura da mandioca no Brasil é ampla, sendo a região Central do Brasil, definida como centro primário de diversidade da cultura, esta variabilidade está relacionada principalmente ao processo de seleção natural e cultural durante a pré e pós-domesticação da espécie nos diversos ambientes. Considerando que a caracterização da diversidade genética de acessos de mandioca é extremamente importante, tanto para os agricultores, quanto para os melhoristas, pois permite à organização dos recursos genéticos e melhor aproveitamento da variabilidade genética disponível, esta pesquisa tem por objetivo analisar a divergência genética, quanto aos caracteres morfológicos, agronômicos, moleculares de acessos de mandioca, pertencentes à coleção da UNEMAT – Cáceres – MT e Embrapa Agrosilvipastoril, provenientes da mesorregião centro-sul do Estado de Mato Grosso. Para tanto, foram utilizados descritores morfoagronômicos propostos por Fukuda & Guevara (1998) e 19 primers de microssatélite SSR. Para a análise dos dados utilizou-se principalmente técnicas de análise multivariadas, sendo confeccionadas diferentes matrizes de dissimilaridade/distância, dependendo da fonte de dados utilizadas. Para dados morfológicos foi utilizado o Índice de Dissimilaridade Genética, para dados agronômicos a Distância Euclidiana Média, para dados moleculares o Índice Jaccard. Além disso, foi realizado uma análise conjunta dos dados, em que o Algoritmo de Gower foi utilizado para a confecção da matriz de dissimilaridade. As matrizes resultantes dos índices foram submetidas a diferentes agrupamentos, sendo estes os métodos de agrupamento de Otimização de Tocher, Hierárquico do UPGMA e Ward-MLM. Os dados moleculares ainda foram submetidos à análise de estruturação genética, empregando-se o método Bayesiano. A matriz de dissimilaridade estimada com base nos descritores morfológicos, demonstrou que a menor estimativa de dissimilaridade foi encontrada para a combinação de acessos UNCA-31 e UNRO-17 (dii’ 0,13), enquanto a maior distância de dissimilaridade encontrada foi entre os acessos UNCA-41 e UNCA-39 (dii’ 0,84). Para os dados agronômicos, a matriz de dissimilaridade Euclidiana iv média apontou os acessos EMCB-01 e EMJA-07 (dii’ 0,59) como os mais dissimilares e os acessos EMCB-17 e EMJA-15 como mais similares (dii´ 0,28). O coeficiente de dissimilaridade de Jaccard, aplicado aos dados moleculares, indicou os acessos EMPO-10 e UNCA-38 como os mais dissimilares (Ijj 0,34), enquanto a combinação de acessos UNRO-06 e UNRO-07 foram indicados como os mais similares (Ijj’ 0,0). Os métodos de agrupamentos, UPGMA e Tocher e Ward - MLM, aplicados aos dados, foram eficientes na distinção dos acessos, tendo discriminados os acessos principalmente pelo local de onde são provenientes. Enquanto que a análise de estruturação populacional, aplicada através do método bayesiano demostrou haver presença de subpopulações dentro das populações estudadas. | ||||||||||||||||||||||||
| Abstract | Cassava (Manihot esculenta Crantz) is an important crop in developing countries, mainly due to their hardiness and ability to produce reasonably well in conditions where other crops would not survive. This ability comes from the natural tolerance of the species to acid soils and drought. The cultivation of cassava in the State Mato Grosso is based on family farming, constituting a source of agricultural income for many rural settlements. Genetic variability for the cassava crop in Brazil is large, being Brazil`s Central region defined as the primary center of diversity of the crop, which is a result of the natural and cultural selection during the pre and post-domestication of the species in different environments. Whereas the characterization of the genetic diversity of cassava accessions is extremely important, both for farmers and for plant breeders, because it allows the organization of genetic resources and better use of genetic diversity available, this research aims to analyze the genetic divergence, as the agronomic, molecular and morphological characters, among accession of cassava from the south-central region of the State of Mato Grosso, belonging to UNEMAT-Cáceres/MT and Embrapa agrosilvipastoril germoplasm collection. For this, morphoagronomic descriptors proposed by Fukuda and Guevara (1998) and 19 SSR microsatellite primers were used. For the data analysis, multivariate analysis techniques were used, and different dissimilarity/distance matrices were applied, depending on the data source. Genetic Dissimilarity Index for morphological data, Euclidean distance for agronomic data the, Jaccard index for molecular data. In addition, a joint data analysis was performed, in which the Gower Algorithm was used to create the dissimilarity matrix. The matrices resulting from the indexes were submitted to different groupings, these being the clustering methods of Tocher, unweighted pair group method with arithmetic mean (UPGMA) and Ward-MLM. The molecular data were still submitted to genetic structuring analysis, using the Bayesian method. The dissimilarity matrix estimated based on the morphological descriptors, showed that the lowest dissimilarity was found for the combination of UNCA-31 and UNRO-17 accessions (dii` 0.13), while the highest distance of dissimilarity was observed between accessions UNCA-41 and UNCA-39 (dii` 0.84). For the agronomic data, the mean Euclidean dissimilarity matrix pointed to the EMCB-01 and EMJA-07 accessions (dii` 59) as the most dissimilar and the EMCB-17 and EMJA-15 accessions as the most similar (dii` 0.28). The Jaccard dissimilarity coefficient, applied to the molecular data, indicated the EMPO-10 and vi UNCA-38 accesses as the most dissimilar (Ijj’ 0.34), while the UNRO-06 and UNRO-07 accessions were indicated as the most similar (Ijj’ 0.0). The clustering methods, UPGMA and Tocher and Ward-MLM, applied to the data, were efficient in distinguishing the accessions, having discriminated the accesses mainly by the place from which they came. While the population structure analysis, applied through the Bayesian method, showed the presence of subpopulations within the populations studied. | ||||||||||||||||||||||||
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