Disciplina | Tópicos Especiais em Biotecnologia: Sistemas CRISPR-Cas. |
Código | BTC-014.48 |
Tipo | Optativa |
Nº de créditos | 4 |
Carga Horária | 30 Teorica / 30 Prática |
Período | 02/2017 |
Nº de Vagas | 10 |
Turma | 01-PA |
Período das Aulas | 05/10/2017 a 24/10/2017 |
Observações | Disciplinas será realizada às quintas e sextas feiras. |
Professores | |
Horários | |
| |
Ementa | |
Histórico, estrutura e função: CRISPR como um sistema imune adaptativo de microrganismos; evidências experimentais. Classificação evolutiva dos sistemas CRISPR-Cas. Genes de bacteriófagos que inativam o sistema imune CRISPR/Cas bacteriano. Identificação e reconstrução de CRISPR-Cas a partir de dados metagenômicos. Estudos do sistema CRISPR-Cas in vitro. Edição genômica em células de mamíferos. Edição genômica terapêutica: perspectivas, desafios e questões éticas. | |
Bibliográfia | |
Jennifer Doudna and Samuel Sternberg. 2017. The crack in evolution.: Gene editing and the Unthinkable power to control evolution. Houghton Mifflin Harcourt Publishing Company, Jinek, M., Chylinski, K., Fonfara, I., Hauer, M., Doudna, J.A., and Charpentier, E. (2012). A programmable dual-RNA-guided DNA endonuclease in adaptive bacterial immunity. Science 337, 816%u2013821. Eric S. Lander. The Heroes of CRISPR. Cell 164, January 14, 2016 Francisco J.M. Mojica, Lluís Montoliu. On the Origin of CRISPR-Cas Technology: From Prokaryotes to Mammals. Trends in Microbiology. 2016 Jul 8. http://dx.doi.org/10.1016/j.tim.2016.06.005. Makarova KS, Wolf YI, Alkhnbashi OS, Costa F, Shah SA, Saunders SJ, Barrangou R, Brouns SJ, Charpentier E, Haft DH, Horvath P, Moineau S, Mojica FJ, Terns RM, Terns MP, White MF, Yakunin AF, Garrett RA, van der Oost J, Backofen R, Koonin EV. An updated evolutionary classification of CRISPR-Cas systems. Nat Rev Microbiol. 2015 Sep 28. Ibtissem Grissa1, Gilles Vergnaud and Christine Pourcel. CRISPRFinder: a web tool to identify clustered regularly interspaced short palindromic repeats., Nucleic Acids Research, 2007, Vol. 35, Web Server issue Juan C. Oliveros, Mònica Franch, Daniel Tabas-Madrid, David San-León, Lluis Montoliu, Pilar Cubas and Florencio Pazos (2016). Breaking-Cas%u2013%u2013interactive design of guide RNAs for CRISPR-Cas experiments for ENSEMBL genomes. Nucleic Acids Research (2016) doi: 10.1093/nar/gkw407. http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/breakingcas" Barrangou, R., and Marraffini, L.A. (2014). CRISPR-Cas systems: Prokaryotes upgrade to adaptive immunity. Mol. Cell 54, 234%u2013244. http://wwwuser.cnb.csic.es/~montoliu/CRISPR/ Cong L, Ran FA, Cox D, Lin S, Barretto R, Habib N, Hsu PD, Wu X, Jiang W, Marraffini LA, Zhang F. Multiplex genome engineering using CRISPR/Cas systems. Science. 2013 Feb 15;339(6121):819-23 Patrick D. Hsu, Eric S. Lander, and Feng Zhang Development and Applications of CRISPR-Cas9 for Genome Engineering. Cell 157, June 5, 2014 Mali, P., Yang, L., Esvelt, K.M., Aach, J., Guell, M., DiCarlo, J.E., Norville, J.E., and Church, G.M. (2013). RNA-guided human genome engineering via Cas9. Science 339, 823%u2013826. Rho M, Wu Y-W, Tang H, Doak TG, Ye Y (2012) Diverse CRISPRs Evolving in Human Microbiomes. PLoS Genet 8(6): e1002441. doi:10.1371/ journal.pgen.1002441 David Burstein, Lucas B. Harrington, Steven C. Strutt, Alexander J. Probst, Karthik Anantharaman, Brian C. Thomas, Jennifer A. Doudna & Jillian F. Banfield (2017) New CRISPR%u2013Cas systems from uncultivated microbes. |